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hanbao

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】实例请教有机分子rietveld拟合与原子占位率问题!谢谢!!

再次呼唤热心虫友的出现了。
这是一个二肽类分子的拟合,利用reflex plus拟合,采用rietveld with energy方法,同时优化了结构与能量,用的是pcff的力场。
拟合的参数有:晶胞参数,峰型参数(UVW,NA,NB),preferred orientation(March-Dollase),背景系数,对称参数(Berar-Baldinozzi),仪器零点,温度因子,原子坐标,没有拟合原子占有率,

最后得到的质量品质为:Rwp:10.03%; Rwp(w/o bck):24.65%; Rp:7.5%

得到的结构很符合假设,氢键网络较全,也没有靠得很近的原子对。

拟合结果见下图:

参数如下:
Profile Function: Pseudo-Voigt  
U 2.45619
V -0.71714
W 0.06867
NA 0.71865
NB 0.00633

Zero Point -0.04270
Shift #1 -0.01301
Shift #2 1.04115

Asymmetry Correction: Berar-Baldinozzi
P1 -0.20738
P2 0.26403
P3 0.26317
P4 -0.56410

Preferred Orientation
a* 0.50405
b* 0.76018
c* -0.40994
R0 1.34694

Global Isotropic Temperature Factors
U 0.00854


先谢谢大家了,我本不是这个专业的,自己凭借软件爱好,觉得挺有意思,折腾了这个东西,但对结果也没有太多判断力,不知道这样的结果能否达到一般的拟合标准,是否就可以了,还有各种参数有没有离谱的地方,

希望能得到各位的慷慨帮助,谢谢!

[ Last edited by hanbao on 2008-5-18 at 13:42 ]
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hanbao

银虫 (小有名气)

原子坐标(Fractional Coordinates吧)我已经修了,忘加上去了,
但是原子占有率不知该怎么去精修,在reflex plus软件,可以进行此项精修,但如果我选中所有的原子,进行精修的话,虽然可以得到更低的Rwp值(7%),但原子占有率对每个原子来说偏差挺大,从0.3到1的都有,不知道这样合不合理,就没有去精修这一项,
请问一般精修原子占有率是将所有的原子都进行精修吗,还是选取部分原子?那又怎么去选,请多指点下,这一块找了很多资料一直没怎么理清楚,谢谢!
6楼2008-05-12 20:52:48
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hanbao

银虫 (小有名气)

在线等,请大家多指导指导罗,
2楼2008-05-12 17:27:45
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mandyneu366

铜虫 (初入文坛)

用的什么软件?GSAS还是FULPRO?
3楼2008-05-12 18:35:26
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hanbao

银虫 (小有名气)

用的是materials studio 4.0,它里面含有reflex plus模块。
4楼2008-05-12 18:48:55
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