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w3863719

银虫 (正式写手)

[求助] VASP提交作业的机制 已有1人参与

刚刚接触VASP,在超算中心编译安装好后,不知道如何使用,有没有高手能帮助一下,提供相应的脚本或者告知vasp在超算上的运行机制,完全没接触过,所以希望得到帮助。谢谢
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Vaucanson

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我们学校的高性能计算中心是用PBS脚本提交计算任务,我使用的如下:
#PBS -S /bin/bash
#PBS -N vasp
#PBS -j oe
##PBS -q patch
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -l walltime=1000:00:00
#PBS -V

cd ${PBS_O_WORKDIR}
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`

source /public/software/mpi/openmpi1.4-intel.sh
mpirun -np $NP -machinefile $PBS_NODEFILE --mca btl self,tcp /public2/home/***/***/tools/vasp/vasp.5.2/vasp > $NP.log

具体有关PBS的东西我也不明白
2楼2014-11-04 21:00:17
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