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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 做MD模拟使用CPU并行好呢，还是GPU并行？
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chenjingzhi

金虫 (小有名气)

[交流] 做MD模拟使用CPU并行好呢，还是GPU并行？

似乎现在是GPU并行更流行啊，大家来交流交流
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1楼 2014-10-30 11:21:12
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chenjingzhi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 分迪科技 at 2014-10-30 23:11:27
GPU的速度的确高于cpu的速度，一般是2-5倍，根据软件不同而不同，目前GPU并行对于速度提升并不大，估计有不到20%的提升，鉴于此，推荐单GPU就好了。
可以看这篇文章：DIY工作站的GPU运行Amber12的测试结果 http:// ...

那像现在的K40大概能抵得上多少核CPU
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3楼2014-10-31 09:13:08
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分迪科技

铁虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chenjingzhi: 金币+3 2014-10-31 09:10:30
GPU的速度的确高于cpu的速度，一般是2-5倍，根据软件不同而不同，目前GPU并行对于速度提升并不大，估计有不到20%的提升，鉴于此，推荐单GPU就好了。
可以看这篇文章：DIY工作站的GPU运行Amber12的测试结果 http://bioms.org/forum.php?mod=v ... ;amp;extra=page%3D1
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http://www.moldesigner.com/ 分迪科技提供分子对接、分子动力学、同源模建、虚拟筛选等技术服务。
2楼2014-10-30 23:11:27
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
chenjingzhi: 金币+5 2014-11-06 15:04:50
本帖内容被屏蔽
4楼2014-11-05 22:10:16
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chenjingzhi

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by smutao at 2014-11-05 22:10:16
我測試過k40的 非常不錯
用namd至少能遞上64線程
...

顺便问一下一个K40大概什么价位
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5楼2014-11-06 15:05:27
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