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六世之爱铜虫 (小有名气)
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MS运行时CPU占用率很低，怎么设置多核并行呀
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我的电脑是i7 四核处理器，内存8G，win7的操作系统，在运行MS进行Demol3计算的时候我发现CPU占用率非常低，不超过20%，内存也不超过45%。不知道怎么样才能设置多核并行计算啊，我现在算的超慢的说。 我还有一个问题，就是计算金属卟啉分子的时候选用compass力场总显示计算失败，最后结果显示为Energy Server failed. The typing engine has failed to calculate a forcefield type for 1 particle. Unable to calculate energy and gradients. Geometry optimization finished with an error condition. 难道是我卟啉分子画错了？我就是先在sketch fragment里面选择金属模板，选4 coordinate D4h，选择原子为锌，然后把剩下的卟吩环画进去了。 [ Last edited by 六世之爱 on 2012-5-11 at 09:43 ] |
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 催化与分子模拟 | 1223 |
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i7四核处理器，是8个线程还是4个线程的？在job control 里有个run in parallel on ? of 4或者8 processors.不管选4还是8个，windows里显示的进程cpu占用率加起来应该接近100%就是正常的。内存Max, memory里设置大点就可以。 compass里没有1个粒子的力场，可能是那个金属原子的力场没找到。 |
2楼2012-05-11 10:20:56
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3楼2012-05-11 10:25:58
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dmol模块里有选择内存设置。动力学模块里确实没有设置内存。动力学计算内存占用量不大。 compass可以计算单分子，但是它并没有覆盖元素周期表。错误提示里没告诉是哪个粒子的参数没有么？可以在discover set up对话框中的typing标签下force field typs确认下，看什么原子或者成键项没有参数 |
4楼2012-05-11 10:37:26
