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gromacs跑能量最小化后蛋白四分五裂了 已有1人参与
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用gromacs跑能量最小化，蛋白会变成下边图那样四分五裂，真空、溶剂，共轭、最陡，都会这样，请问这是怎么回事，由如何解决呢？看着像正方形，可是在做真空能量最小化没有加盒子的情况下，怎么也是正方形的？ ps：这个结构是我在另一个蛋白上删除了20多个氨基酸后跑的，未删除的那个蛋白跑能量最小化没有问题 |
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