24小时热门版块排行榜    

查看: 7539  |  回复: 13

monkey_pxs

金虫 (小有名气)

[求助] 关于设计引物时终止密码子是否可以直接敲掉的问题 已有1人参与

我在设计一个引物克隆目的基因片段,由于考虑到后续的基因表达,所以在设计引物的时候想着是否可以直接把终止密码子(终止密码子刚好是最后三个碱基)敲掉不用,或者将终止密码子替换成其他的碱基(考虑GC比)?
回复此楼
人只有在真正做事过程中才会明白以前想的那些压抑难受什么的都是太闲了想多了的结果。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

litter_wai

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by monkey_pxs at 2014-10-16 23:13:06
还有,保护性碱基是怎么算的啊,我怎么加才叫加的是保护性碱基?好吧,问题比较傻,呵呵...

删掉终止密码子完全没问题,也可以不考虑补加碱基,酶切位点保护碱基的密码子最终不会出现在表达载体上

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 酶切位点保护碱基.doc
  • 2014-10-19 16:15:00, 65.5 K
13楼2014-10-19 16:14:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
据我所知是可以的哦

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-10-16 22:05:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

monkey_pxs

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yuguiyan at 2014-10-16 22:05:10
据我所知是可以的哦

恩,那我可以不可以替换掉,比如为了满足GC比将TAA换成CGG或者其他碱基之类的?
人只有在真正做事过程中才会明白以前想的那些压抑难受什么的都是太闲了想多了的结果。
3楼2014-10-16 22:36:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
3楼: Originally posted by monkey_pxs at 2014-10-16 22:36:43
恩,那我可以不可以替换掉,比如为了满足GC比将TAA换成CGG或者其他碱基之类的?...

不替换也可以吧

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-10-16 22:45:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

monkey_pxs

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuguiyan at 2014-10-16 22:45:54
不替换也可以吧
...

恩,我知道直接不要就可以了,但是为了满足GC含量我可否就是设计引物的时候把原来终止密码子的碱基换成其他的,这样在实际操作的时候会否有影响?或者理论是否可行?
人只有在真正做事过程中才会明白以前想的那些压抑难受什么的都是太闲了想多了的结果。
5楼2014-10-16 22:48:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by monkey_pxs at 2014-10-16 22:48:04
恩,我知道直接不要就可以了,但是为了满足GC含量我可否就是设计引物的时候把原来终止密码子的碱基换成其他的,这样在实际操作的时候会否有影响?或者理论是否可行?...

没试过啊不能瞎说

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-10-16 23:07:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

monkey_pxs

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yuguiyan at 2014-10-16 23:07:33
没试过啊不能瞎说
...

呵呵。好吧,那理论呢,换个说法,就类似于佳保护性碱基,我就是把那个ATT敲掉不用,然后在5'端加几个保护性碱基而已,这样理论可行吗?
人只有在真正做事过程中才会明白以前想的那些压抑难受什么的都是太闲了想多了的结果。
7楼2014-10-16 23:11:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
7楼: Originally posted by monkey_pxs at 2014-10-16 23:11:14
呵呵。好吧,那理论呢,换个说法,就类似于佳保护性碱基,我就是把那个ATT敲掉不用,然后在5'端加几个保护性碱基而已,这样理论可行吗?...

可行

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2014-10-16 23:11:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

monkey_pxs

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by yuguiyan at 2014-10-16 23:11:54
可行
...

还有,保护性碱基是怎么算的啊,我怎么加才叫加的是保护性碱基?好吧,问题比较傻,呵呵
人只有在真正做事过程中才会明白以前想的那些压抑难受什么的都是太闲了想多了的结果。
9楼2014-10-16 23:13:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lf6220

至尊木虫 (著名写手)

当然可以替换了,有个酶切位点保护碱基表,你可以百度一下

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
10楼2014-10-17 07:35:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 monkey_pxs 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 什么时候开奖? +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 10/500 2026-08-23 07:17 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 03:52 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见