| 查看: 1059 | 回复: 1 | ||
keke_1210木虫 (小有名气)
|
[求助]
amber 配体各基团与受体之间的能量分析
|
|
我是想算下配体小分子各基团与受体之间的自由能差，比较各个官能团的对药物修饰的差异，可是在网上查的好像只能用amber9。一直不太清楚amber开发为什么把anal这个程序包在amber10之后就给去掉了，觉得还挺有用的，也不知道amber12里有没有整合进这个功能，还有为什么给去掉了？对比了amber9和amber12手册的anal部分，对于anal的介绍都是相似的，amber12中，appendix中B GROUP Specification进行了介绍，挺纳闷的有介绍没程序。想问下各位在遇到此问题的时候是怎么解决的？ 看文献里，有人用namd将药物分子分成了几个fragment进行了与受体的能量分析。 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
回复此楼» 猜你喜欢
材料专硕306英一数二
已经有6人回复
-
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有26人回复
-
机械专硕325，寻找调剂院校
已经有4人回复
-
333求调剂
已经有7人回复
-
考研化学学硕调剂，一志愿985
已经有4人回复
-
0854控制工程 359求调剂 可跨专业
已经有9人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有9人回复
-
化学调剂0703
已经有8人回复
-
环境工程调剂
已经有6人回复
-
326求调剂
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 在autodock软件中如何将配体和受体拆分开
已经有9人回复
- 分子对接时配体跟受体分开很远，配体不在受体活性口袋
已经有7人回复
- 蛋白质、核酸、抗原、抗体、酶、配体、受体，生长因子，细胞因子等等之间的关系是什么
已经有4人回复
- 怎么确定一种物质是某一受体的配体？
已经有3人回复
- 蛋白质和什么化学基团（配体）可以（可逆的）形成共价键
已经有11人回复
- 用autodock做对接，box设置无法包括受体活性区域和配体
已经有6人回复
- 做分子对接前选择配体和受体时有什么要求吗？
已经有5人回复
2楼2018-01-28 17:25:02
20