24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 459  |  回复: 5
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liumikewolf

金虫 (小有名气)

[交流] 以基因组DNA为模板,pcr扩增到的片段与测序标准株差别很大,原因?

以基因组DNA为模板,进行pcr扩增,电泳发现产物为单一的条带,大小与目地片段相当,测序发现该片段与测序标准株基因序列差别很大,原因是什么?是由于基因组本身与测序标准株有很大差别,还是pcr非特异性扩增到了错误的片段,或者是测序出了问题?该如何判断呢?主要是依据什么标准?请大家帮助!!!!!
[search]pcr[/search]
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greenspringmi

银虫 (正式写手)

是说这个片段以前扩增过,现在扩增的和以前的进行比对时发现差别很大啊;还是扩增出来的序列在NCBI 上比对和你需要的片段差别很大啊
3楼2008-04-30 08:02:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

annwt

木虫 (正式写手)

在PCR扩增中,会产生错误,但是是有限的,不同的酶出错机会不等,如果作功能一般用高保真酶。
一般测序公司的测序反应也是PCR过程,出错几率应该不会影响结果分析。
在pcr中,貌似单一条代,实际条代是混合物,是多种物质,仅仅大小一样而已。
你的问题:
在从新找标准序列,分析差距是否可以接受。
与测序公司沟通,了解他们的技术路线。
实在没有结果只好再转化,再测序,也许你会有新的发现。
2楼2008-04-30 07:45:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liumikewolf

金虫 (小有名气)

扩增出来的序列在NCBI 上比对和需要的片段差别很大
4楼2008-04-30 09:04:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liumikewolf

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by annwt at 2008-4-30 07:45:
在PCR扩增中,会产生错误,但是是有限的,不同的酶出错机会不等,如果作功能一般用高保真酶。
一般测序公司的测序反应也是PCR过程,出错几率应该不会影响结果分析。
在pcr中,貌似单一条代,实际条代是混合物, ...

如何确定与标准序列差距是否可以接受?identity达到多大?
5楼2008-04-30 09:08:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070305高分子化学与物理 304分求调剂 +7 c297914 2026-03-28 7/350 2026-03-29 01:17 by 544594351
[考研] 调剂310 +7 温柔的晚安 2026-03-25 8/400 2026-03-29 01:09 by 我是小康
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +4 大馋小子 2026-03-28 4/200 2026-03-29 00:32 by 544594351
[考研] 一志愿太原理工安全工程300分,求调剂 +5 0857求调剂. 2026-03-24 6/300 2026-03-28 22:04 by zhq0425
[考研] 22408 359分调剂 +4 Qshers 2026-03-27 5/250 2026-03-28 21:26 by zhq0425
[考研] 一志愿华理,数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 12/600 2026-03-28 18:15 by AZMK
[考研] 085701环境工程,267求调剂 +16 minht 2026-03-26 16/800 2026-03-28 12:16 by zllcz
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考研] 一志愿211院校 344分 东北农业大学生物学学硕,求调剂 +5 丶风雪夜归人丶 2026-03-26 8/400 2026-03-27 19:22 by 丶风雪夜归人丶
[考研] 085601 材料工程 313分 求调剂 +5 Ong3 2026-03-27 5/250 2026-03-27 12:24 by goldfish51
[考研] 考研调剂 +9 小蜡新笔 2026-03-26 9/450 2026-03-27 11:10 by 不吃魚的貓
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
[考研] 304材料求调剂 +4 钟llll 2026-03-26 4/200 2026-03-27 03:42 by wxiongid
[考研] 351求调剂 +4 麦克阿磊 2026-03-24 4/200 2026-03-27 00:32 by wxiongid
[考研] 342求调剂 +3 加油a李zs 2026-03-26 3/150 2026-03-27 00:29 by wxiongid
[考研] 329求调剂 +5 1() 2026-03-22 5/250 2026-03-26 20:40 by fmesaito
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-26 4/200 2026-03-26 16:00 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
信息提示
请填处理意见