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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 蛋白与多肽对接问题求助
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tone鹅

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白与多肽对接问题求助 已有3人参与

蛋白与多肽用DOCK柔性对接。老是显示错误。格点不够大。修改盒子大小，spheres都不行。在做刚性对接时，能量值正数，上千，多肽有一部分侧链进入蛋白质。各种参数都改了还是一样。求助大神啊
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1楼 2014-09-28 10:33:41
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tone鹅: 金币+6, ★★★很有帮助 2014-10-22 11:44:10
本帖内容被屏蔽
2楼2014-09-30 03:36:04
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
多肽氨基酸有多少？太多的话可以考虑蛋白—蛋白对接吧
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3楼2014-09-30 08:38:01
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earth

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用autodock vina试试。
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4楼2014-09-30 21:56:08
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liangh36

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by earth at 2014-09-30 21:56:08
用autodock vina试试。

想问问如果有非天然氨基酸的多肽，要怎么导入序列
赞一下 回复此楼
5楼2023-02-02 18:41:20
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