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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP运行错误
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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diyiyuanli

银虫 (小有名气)

[求助] VASP运行错误 已有1人参与

信息：
VERY BAD NEWS! internal error in subroutine SGRCON:
Found some non-integer element in rotation matrix
-------------------------------------------------------------------
POSCAR文件
co666\(0\0\1)slab
1.0
        7.1065998077         0.0000000000         0.0000000000
       -3.5532824496         3.5532824496         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        17.3299999237
   Co
   16
Direct
     0.000000000         0.000000000         0.102519996  F F F
     0.000000000         0.000000000         0.307559997  T T T
     0.250000000         0.000000000         0.000000000  F F F
     0.250000000         0.000000000         0.205039993  T T T
     0.500000000         0.000000000         0.102519996  F F F
     0.500000000         0.000000000         0.307559997  T T T
     0.750000000         0.000000000         0.000000000  F F F
     0.750000000         0.000000000         0.205039993  T T T
     0.000000000         0.500000000         0.102519996  F F F
     0.000000000         0.500000000         0.307559997  T T T
     0.250000000         0.500000000         0.000000000  F F F
     0.250000000         0.500000000         0.205039993  T T T
     0.500000000         0.500000000         0.102519996  F F F
     0.500000000         0.500000000         0.307559997  T T T
     0.750000000         0.500000000         0.000000000  F F F
     0.750000000         0.500000000         0.205039993  T T T
-------------------------------------------------------------------------------------
INCAR文件
SYSTEM=co
ISTART=0
ICHARG=2
ISMEAR=0
SIGMA=0.1
ENCUT=400
EDIFF=1E-4
EDIFFG=-0.05
GGA=RP
NSW=200
POTIM=0.3
LREAL=Auto
IBRION=2
ISPIN=2
VOSKOWN=1
ISIF=2
-----------------------------------------------------------------
KPOINT文件
Automatic generation
0
Monkhorst-Pack
8 8 1
0 0 0
-------------------------------------------------------------------
已经修改过K点设置。
谢谢！！
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理论计算很有意思！
1楼 2014-09-23 18:35:18
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
diyiyuanli: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-09-23 20:53:22
相當有趣的問題

最簡單的解決方法是
在 INCAR 內加入 ISYM=0
使 VASP 不要去偵測結構對稱性
但~這方法還挺不建議的

另一種作法
把原本的 lattice constant and lattice vectors 設定
co666\(0\0\1)slab
1.0
        7.1065998077         0.0000000000         0.0000000000
       -3.5532824496         3.5532824496         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        17.3299999237
   Co
   16

改成
co666\(0\0\1)slab
3.5532824496
        2.0000000000         0.0000000000         0.0000000000
       -1.0000000000         1.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000         4.8771805139
   Co
   16

如此一?韣VASP就能找到正確的對稱群了
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2楼2014-09-23 20:09:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diyiyuanli

银虫 (小有名气)
这个问题刚刚解决了！
导入数据的过程如下：MS导出cif文件，由VESTA打开再导出vasp文件，然后将vasp文件导入服务器。
其中的错误在于：-3.5532824496         3.5532824496         0.0000000000
切的格子为45+135的，该行的正确坐标应该是：0.0000000000  5.02510000  0.0000000000
这个意思是坐标发生了变化！！进而出现了问题中的错误！
希望这个问题的发现能给大家带了一定的警示作用，导出坐标后要仔细检查。
谢谢！
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理论计算很有意思！
3楼2014-09-23 20:10:40
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diyiyuanli

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2014-09-23 20:09:22
相當有趣的問題

最簡單的解決方法是
在 INCAR 內加入 ISYM=0
使 VASP 不要去偵測結構對稱性
但~這方法還挺不建議的

另一種作法
把原本的 lattice constant and lattice vectors 設定
co666\(0\0\1)slab ...

你是高人啊！我刚有些急，直接回了自己的帖子。
现在又出来了一个问题，怎么判断自己得到POSCAT文件的合理性？
我得到POSCAR
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理论计算很有意思！
4楼2014-09-23 20:59:50
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diyiyuanli

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2014-09-23 20:09:22
相當有趣的問題

最簡單的解決方法是
在 INCAR 內加入 ISYM=0
使 VASP 不要去偵測結構對稱性
但~這方法還挺不建議的

另一種作法
把原本的 lattice constant and lattice vectors 設定
co666\(0\0\1)slab ...

我得到POSCAR的方法是根据太原理工大学量子化学课题组的方法，即：cif方法。MS导出，VESTA导入再导出得到vasp文件。然后，可以用UE软件编辑等。
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理论计算很有意思！
5楼2014-09-23 21:01:34
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
fzx2008: 金币+5, 谢谢指导 2014-09-24 15:14:57
"????ж??????? POSCAR ???????????"

??...............
?@.....................
??????f........
???B????W???????

??????@??????
???????????????? Co(001) surface structure
?????????
1. Co ?? bulk ?? HCP ?Y?????? a1, a2, a3, c ??e?????
   ???? lattice vector ?A??????
2. ?????? 001 ?? (???????? 0001 ?棬??? HCP structure ??????? index)
    ??????????HCP(0001) ?? ABABAB...  stacking
    ??????????surface lattice vectors ??A??? 60 ??
3. ????ˊA?? 60 ??  
    surface lattice vector ??????N?x??
4. ???????????????? unit cell ??? supercell
5. ??????????c????g????x

????????@Щ....
??????Д????????? POSCAR ??????...............

   
???^~?f???
??????????@???c???????
???????????? "?????????????????????????"
POSCAR ~ ???????? key ??????
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diyiyuanli
6楼2014-09-23 22:13:29
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gaarakingBMY

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2014-09-23 20:09:22
相當有趣的問題

最簡單的解決方法是
在 INCAR 內加入 ISYM=0
使 VASP 不要去偵測結構對稱性
但~這方法還挺不建議的

另一種作法
把原本的 lattice constant and lattice vectors 設定
co666\(0\0\1)slab ...

您好，请问这样的两种写法不是一样的么？两者有什么区别呢？
co666\(0\0\1)slab
1.0
        7.1065998077         0.0000000000         0.0000000000
       -3.5532824496         3.5532824496         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000        17.3299999237
   Co
   16

改成
co666\(0\0\1)slab
3.5532824496
        2.0000000000         0.0000000000         0.0000000000
       -1.0000000000         1.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         0.0000000000         4.8771805139
   Co
   16
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7楼2014-09-23 23:10:07
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gaarakingBMY at 2014-09-23 23:10:07
您好，请问这样的两种写法不是一样的么？两者有什么区别呢？
co666\(0\0\1)slab
1.0
        7.1065998077         0.0000000000         0.0000000000
       -3.5532824496         3.5532824496         0. ...

以結構?碚f
這兩者是一模一樣的

但~對於程式而言 (VASP)
處理的結果 "可能" 會不完全一樣
細部內容要看 VASP source code 才能知曉
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gaarakingBMY
8楼2014-09-24 02:58:44
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gaarakingBMY

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by jpchou at 2014-09-24 02:58:44
以結構?碚f
這兩者是一模一樣的

但~對於程式而言 (VASP)
處理的結果 "可能" 會不完全一樣
細部內容要看 VASP source code 才能知曉...

好的，谢谢您！
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9楼2014-09-24 08:27:57
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diyiyuanli

银虫 (小有名气)
送红花一朵
???????:
6?: Originally posted by jpchou at 2014-09-23 22:13:29
"????ж??????? POSCAR ???????????"

??...............
?@.....................
??????f........
???B????W???????

??????@??????
???????????????? Co(001) surface structur ...

лл!!
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理论计算很有意思！
10楼2014-09-24 08:53:23
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