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xiaoaige

金虫 (正式写手)

[求助] 碳纳米管轴向周期性的模型怎么建立?

我用的是MS软件,需要计算烷烃分子在碳管内的相变,建模遇到困难,希望大家帮忙解答下。
我参照的很多文献都是这样做的,“建立一个碳纳米管的盒子,使其在轴向具有周期性”+“碳纳米管处理为刚性原子,其原子位置固定不动”。
首先,我不知道怎样建这个碳管模型,使其在轴向具有周期性。目前,我用Amorphous Cell建了个模型,如图1,这样的碳管根本不居中,而且应该也是没有轴向周期性的。
其次,在前期计算中,我采用Modify-Constraints-Fix Cartesian position固定碳管不动,不知道这种方法是否处理正确,因为在后期计算中管内的东西全跑出来了,如图3,我们在前面大量计算已经证明管内(碳管未固定)的分子是不会跑出来的。

碳纳米管轴向周期性的模型怎么建立?
图1.jpg


碳纳米管轴向周期性的模型怎么建立?-1
图2.jpg


碳纳米管轴向周期性的模型怎么建立?-2
图3.jpg
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xiaoaige

金虫 (正式写手)

这个坛子好冷
Fighting!!!Fighting!!!Fighting!!!Fighting!!!Fighting!!!Fighting!!!
2楼2014-09-18 17:05:45
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