| 查看: 556 | 回复: 0 | |||
[求助]
求助，一个bash脚本中的命令调用一个模块，然后再次输入命令的问题！！
|
|
我写了一个脚本，但是遇到了点问题： ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ #!/bin/bash #$ -S /bin/bash #$ -cwd #echo 'date' #$ -o /dev/null #$ -e /dev/null cd /nibs02/sbfang/SPA_maker/pre_preparation/ parmchk -i 4d8c-1.mol2 -f mol2 -o 4d8c-1-lig.frcmod tleap source leaprc.gaff source leaprc.ff99SB UNK = loadmol2 4d8c-1.mol2 loadamberparams 4d8c-1-lig.frcmod saveamberparm UNK 4d8c-1-lig.promtop 4d8c-1-lig.inpcrd DDD = loadpdb rec.pdb saveAmberParm DDD 4d8c-1-rec.top 4d8c-1-rec.crd 4d8c-1-complex = combine {DDD,UNK} saveAmberParm 4d8c-1-complex 4d8c-1-complex.top 4d8c-1-complex.crd quit ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ 这里面 tleap 命令打开一个新的终端 -I: Adding /opt/amber12/dat/leap/prep to search path. -I: Adding /opt/amber12/dat/leap/lib to search path. -I: Adding /opt/amber12/dat/leap/parm to search path. -I: Adding /opt/amber12/dat/leap/cmd to search path. Welcome to LEaP! (no leaprc in search path) > 需要在新的终端中输入它下面的命令 > source leaprc.gaff > source leaprc.ff99SB > UNK = loadmol2 4d8c-1.mol2 > loadamberparams 4d8c-1-lig.frcmod >saveamberparm UNK 4d8c-1-lig.promtop 4d8c-1-lig.inpcrd > DDD = loadpdb rec.pdb > saveAmberParm DDD 4d8c-1-rec.top 4d8c-1-rec.crd > 4d8c-1-complex = combine {DDD,UNK} > saveAmberParm 4d8c-1-complex 4d8c-1-complex.top 4d8c-1-complex.crd 如果一条一条的输入，太麻烦，可不可以说一下，怎么用以个命令让它一气呵成跑到底呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
人工智能320调剂08工类还有机会吗
已经有17人回复
-
考研英一数一338分
已经有10人回复
-
求助调剂，跨调
已经有15人回复
-
085600材料与化工329分求调剂
已经有20人回复
-
085600材料与化工349分求调剂
已经有15人回复
-
求调剂
已经有13人回复
-
一志愿华南理工大学331分材料求调剂
已经有11人回复
-
271求调剂
已经有40人回复
-
求调剂学校
已经有3人回复
-
332求调剂
已经有15人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
求助一个关于Linux下的VASP故障的问题
已经有6人回复
- 求大神帮忙解释截断能测试中的问题！
已经有7人回复
- ANSYS中对一组体的选择集，怎么用ADPL命令流获取这组体的编号到一个数组里啊？
已经有3人回复
- PBS脚本的编写问题
已经有15人回复
- 【求助】lammps关于fix ave/spatial命令应用问题
已经有4人回复
- 一个PBS脚本同时运行多个任务
已经有6人回复
- 各位大神，求一个脚本解决我服务器资源不足的问题
已经有8人回复
- 怎么使linux或者shell下的wget命令在python脚本中起作用
已经有5人回复
- 求助MS60在linux安装完后导入licenses可否有命令的方法？
已经有25人回复
- BASH脚本的一个小问题
已经有3人回复
- comfa 新手求助：sybyl x1.2 教程里的一些操作命令
已经有4人回复
- 如何编写PBS作业的脚本？
已经有14人回复
- 【求助】重金求助：gromacs中g_rms命令中怎样应用index.ndx文件
已经有8人回复
- 【求助】怎样把linux的bash脚本编译成windows下的可执行文件（.exe）
已经有16人回复
- 【求助】能同时在linux系统下安装g09和g03吗？
已经有14人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
