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a你123

新虫 (初入文坛)

[求助] 质谱分析求助

我的样品是多肽,但是不知道它的结构,通过MSMS得到了一些数据,通过质谱图推导了一下它的氨基酸序列, 然后,我想问一下,如何才能验证得到的序列是正确的呢?

小弟第一次做质谱,好多地方不明白,求指导啊!!!!  谢谢各位了
  

另外, 如果从二级质谱图直接推导它的序列,需要注意些什么呢? 该如何去寻找它的b,y 离子呢?  质谱图上有些离子是不是可能不会出现?
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1楼 2014-09-17 12:36:24
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好朋友的祝福

木虫 (正式写手)
光是MS是没法推导它序列的！我举个简单的例子：Ser-Ala-Gly 跟Ser-Gly-Ala 氨基酸调换下顺序，MS还是一样的MS，这个是空间结构不一样！同理：光学结构不一样的：比如Ser-Ala-Gly  跟D-Ser-D-Ala-Gly 的MS还是一样的！所以你要知道序列，只能测序！
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2楼2014-09-18 08:51:28
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崔利利123

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 好朋友的祝福 at 2014-09-18 08:51:28
光是MS是没法推导它序列的！我举个简单的例子：Ser-Ala-Gly 跟Ser-Gly-Ala 氨基酸调换下顺序，MS还是一样的MS，这个是空间结构不一样！同理：光学结构不一样的：比如Ser-Ala-Gly  跟D-Ser-D-Ala-Gly 的MS还是一样的 ...

如何测序？使用什么数据库？我是刚接触质谱，还请大神帮忙
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3楼2016-11-04 12:07:21
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