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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 55555 这个是怎么了
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郭嘉945

银虫 (初入文坛)

[交流] 55555 这个是怎么了 已有1人参与

我用gromacs跑tutorial的第一个，水中的溶菌酶，为什么在加水那一步生成的拓扑文件是空的？
伤脑筋
命令是genbox -cp 1AKI_newbox.gro -cs spc216.gro -o 1AKI_solv.gro -p topol.top
版本是4.5.4的win版
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870277182

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1楼 2014-09-14 15:04:40
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870277182

铁虫 (小有名气)
★
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这个问题很简答嘛，就是在你第一步让你选择水分子力场的时候选错了，你选择spc力场就行了，我估计你是选的none
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2楼2014-09-15 16:47:34
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郭嘉945

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 870277182 at 2014-09-15 16:47:34
这个问题很简答嘛，就是在你第一步让你选择水分子力场的时候选错了，你选择spc力场就行了，我估计你是选的none

不是这个问题啊

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2014-09-16 12:06:59
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