应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » g_mmpbsa 计算过程中的问题
51/1返回列表
查看: 1416  |  回复: 2
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhuimeng08

银虫 (正式写手)

[交流] g_mmpbsa 计算过程中的问题已有1人参与

我刚安装gromacs-4.6.5的g_mmpbsa计算配体小分子和蛋白的能量，用g_mmpbsa计算
按章教程一步步的计算

输入命令：g_mmpbsa     -f    *.xtc   -s   *.tpr   -i    polar.mdp -n   mmpbsa.ndx -nomme -pbsa -decomp -pol polar.xvg -pcon contrib_polar.dat -b 9500 -e 10000


已经算了一天了，但是看不见相应的输出xvg文件盒dat文件，也还没有结束，还在算！
这是怎么回事？
求指导
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2014-09-11 21:53:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huyanqiu

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问下楼主，用g_mmpbsa算了多久啊，我算polar算了三天多还没算完

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2018-06-12 09:58:47
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答
查看全部 3 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭