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zhuimeng08

银虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1381.8
散金: 153
红花: 2
帖子: 435
在线: 276小时
虫号: 1254053
注册: 2011-04-03
专业: 药物化学

[交流] g_mmpbsa 计算过程中的问题已有1人参与

我刚安装gromacs-4.6.5的g_mmpbsa计算配体小分子和蛋白的能量，用g_mmpbsa计算
按章教程一步步的计算

输入命令：g_mmpbsa -f *.xtc -s *.tpr -i polar.mdp -n mmpbsa.ndx -nomme -pbsa -decomp -pol polar.xvg -pcon contrib_polar.dat -b 9500 -e 10000

已经算了一天了，但是看不见相应的输出xvg文件盒dat文件，也还没有结束，还在算！
这是怎么回事？
求指导

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1楼 2014-09-11 21:53:56

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huyanqiu

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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红花: 1
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在线: 5.9小时
虫号: 4362535
注册: 2016-01-17
专业: 计算机软件

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

请问下楼主，用g_mmpbsa算了多久啊，我算polar算了三天多还没算完

发自小木虫Android客户端

3楼2018-06-12 09:58:47

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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