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zhuimeng08

银虫 (正式写手)

[交流] g_mmpbsa 计算过程中的问题 已有1人参与

我刚安装gromacs-4.6.5的g_mmpbsa计算配体小分子和蛋白的能量,用g_mmpbsa计算
按章教程一步步的计算

输入命令:g_mmpbsa     -f    *.xtc   -s   *.tpr   -i    polar.mdp -n   mmpbsa.ndx -nomme -pbsa -decomp -pol polar.xvg -pcon contrib_polar.dat -b 9500 -e 10000


已经算了一天了,但是看不见相应的输出xvg文件盒dat文件,也还没有结束,还在算!
这是怎么回事?
求指导
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zhuimeng08

银虫 (正式写手)

已经解决
2楼2014-10-16 15:54:32
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huyanqiu

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问下楼主,用g_mmpbsa算了多久啊,我算polar算了三天多还没算完

发自小木虫Android客户端
3楼2018-06-12 09:58:47
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