24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1455  |  回复: 2

zhuimeng08

银虫 (正式写手)

[交流] g_mmpbsa 计算过程中的问题 已有1人参与

我刚安装gromacs-4.6.5的g_mmpbsa计算配体小分子和蛋白的能量,用g_mmpbsa计算
按章教程一步步的计算

输入命令:g_mmpbsa     -f    *.xtc   -s   *.tpr   -i    polar.mdp -n   mmpbsa.ndx -nomme -pbsa -decomp -pol polar.xvg -pcon contrib_polar.dat -b 9500 -e 10000


已经算了一天了,但是看不见相应的输出xvg文件盒dat文件,也还没有结束,还在算!
这是怎么回事?
求指导
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuimeng08

银虫 (正式写手)

已经解决
2楼2014-10-16 15:54:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huyanqiu

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请问下楼主,用g_mmpbsa算了多久啊,我算polar算了三天多还没算完

发自小木虫Android客户端
3楼2018-06-12 09:58:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhuimeng08 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 专硕0854初试考材科基,求调剂 +6 3220548044 2026-04-06 9/450 2026-04-06 10:26 by barlinike
[考研] 0855求调剂材料 +11 红桃灼灼 2026-04-04 12/600 2026-04-06 10:26 by 蓝云思雨
[考研] 331求调剂 +8 于征yz 2026-04-05 8/400 2026-04-06 00:54 by fmesaito
[考研] 086000生物与医药 初试274求调剂 +6 小叮当来了 2026-03-30 7/350 2026-04-05 20:30 by lys0704
[考研] 085500机械专硕初试288求调剂 +3 GZJguo666- 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:06 by jkddd
[考研] 工科277分求调剂材料 +8 上了上了上哦 2026-04-05 9/450 2026-04-05 13:05 by wwytracy
[考研] 285求调剂 +11 哦呦呼o 2026-04-04 11/550 2026-04-05 08:15 by 544594351
[考研] 344材料与化工调剂 +9 调剂上岸玘 2026-04-03 9/450 2026-04-04 23:10 by happyddm
[考研] 295求调剂 +4 A你好研究生 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:46 by yu221
[考研] 085601,一志愿厦大334复试被刷求调剂 +13 曾仰之 2026-04-03 15/750 2026-04-04 20:13 by dongzh2009
[考研] 277工科求调剂 +7 1915668 2026-04-04 7/350 2026-04-04 17:21 by 啊俊!
[考研] 334求调剂 +8 曾仰之 2026-04-03 8/400 2026-04-04 11:16 by w_xuqing
[考研] 282求调剂 +20 ycy1201 2026-04-01 22/1100 2026-04-04 00:42 by userper
[考研] 一志愿中国石油大学化学工程323分求调剂 +4 化工专硕323分 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:12 by dongzh2009
[考研] 273求调剂 +20 李芷新1 2026-03-31 20/1000 2026-04-03 09:58 by linyelide
[考研] 专硕 351 086100 也是考的材科基 本科也是材料 +8 202451007219 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:50 by 蓝云思雨
[考研] 309求调剂 +14 呆菇不是戴夫 2026-04-02 14/700 2026-04-03 09:42 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿华南师范大学-22408计算机-292分-求华南师范大学调剂 +4 爱读书的小鳄鱼 2026-04-02 4/200 2026-04-02 18:35 by 求调剂zz
[考研] 348求调剂 +11 zzzzyk123 2026-04-01 11/550 2026-04-02 16:52 by Wang200018
[硕博家园] 考研调剂 +5 骆驼男人 2026-04-01 5/250 2026-04-01 14:28 by syjjj0321
信息提示
请填处理意见