| 查看: 2024 | 回复: 5 | |||
shuangliwang铁杆木虫 (小有名气)
超级终结者
|
[求助]
有关生物大分子的计算，如何得到.wfn文件？ 已有3人参与
|
|
前段时间对生物大分子进行计算，遇到了下面的问题，请大神指教： 1.从外文网站上下载了分子的.pdf文件 2.导入GaussianView加氢后，输出分子的坐标。 3.在工作站进行计算结束后，未得到所需的.wfn文件。<这一步未对分子未进行优化> 不知下步如何处理？ 下面是部分输出内容： ---------------------------------------- #B3LYP/6-31G* opt density nosymm out=wfn ---------------------------------------- 1/14=-1,18=20,19=15,26=3,38=1/1,3; 2/9=110,12=2,15=1,17=6,18=5,40=1/2; 3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3; 4//1; 5/5=2,38=5/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,22=-1,28=1,31=1/1; 7/30=1/1,2,3,16; 1/14=-1,18=20,19=15/3(2); 2/9=110,15=1/2; 99/6=1100/99; 2/9=110,15=1/2; 3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3; 4/5=5,16=3/1; 5/5=2,38=5/2; 7/30=1/1,2,3,16; 1/14=-1,18=20,19=15/3(-5); 2/9=110,15=1/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,22=-1,28=1,31=1/1; 99/6=1100,9=1/99; ------ winter ------ Symbolic Z-matrix: Charge = 0 Multiplicity = 1 N -15.189 -11.394 -5.715 C -14.637 -10.165 -5.079 C -13.113 -10.218 -5.11 O -12.497 -11.126 -4.551 C -15.116 -10.081 -3.629 C -16.617 -9.815 -3.602 O -17.059 -8.693 -3.848 ............. Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Job cpu time: 1 days 5 hours 30 minutes 51.5 seconds. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. File lengths (MBytes): RWF= 36546 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1555 Scr= 1 谢谢！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 高斯 |
» 猜你喜欢
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有165人回复
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最经典的一本表面上化学相互作用教材
已经有0人回复
-
诚邀有志之士加入江苏大学环境学院合成生物学课题组！(长期接收学硕专硕、硕博连读)
已经有16人回复
-
一志愿南大理论与计算化学方向（070300）342分，求调剂
已经有1人回复
-
欢迎化学、化工、物理、材料、或计算机背景的考研咨询
已经有0人回复
-
招生材料与化工、环境科学调剂研究生
已经有5人回复
-
调剂招生
已经有7人回复
-
河南理工大学化工学院招收调剂生啦！
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于使用Multiwfn计算ELF的Basin积分的问题
已经有6人回复
- 使用Multiwfn计算的乙醇体积和查到的数据偏差很大，求前辈解析原因！
已经有17人回复
- Multiwfn如何才能调出Castep和DMol3关于周期性结构所计算出的波函数？
已经有7人回复
- 使用Multiwfn基于完全态求和(SOS)方法计算极化率和超极化率
已经有8人回复
- 利用Multiwfn计算Gaussian输出的激发态之间的跃迁偶极矩
已经有5人回复
- 矩阵的本征矢量
已经有6人回复
- 使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度
已经有18人回复
- 【讨论】计算3分子体系的相互作用能（1个中性分子+一个阳离子+一个阴离子）
已经有5人回复
戴世杰
木虫 (著名写手)
- 应助: 103 (高中生)
- 金币: 4018.4
- 散金: 1099
- 红花: 18
- 帖子: 1218
- 在线: 745.7小时
- 虫号: 1275484
- 注册: 2011-04-23
- 专业: 食品加工技术
2楼2014-08-23 15:01:26
shuangliwang
铁杆木虫 (小有名气)
超级终结者
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 5305.3
- 红花: 1
- 帖子: 253
- 在线: 30.2小时
- 虫号: 2364849
- 注册: 2013-03-21
- 专业: 原子和分子物理
3楼2014-08-23 16:43:32
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
4楼2014-08-23 18:05:55
shuangliwang
铁杆木虫 (小有名气)
超级终结者
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 5305.3
- 红花: 1
- 帖子: 253
- 在线: 30.2小时
- 虫号: 2364849
- 注册: 2013-03-21
- 专业: 原子和分子物理
5楼2014-08-25 11:04:15
chu5263821
铜虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 630.1
- 红花: 1
- 帖子: 58
- 在线: 42.3小时
- 虫号: 3379532
- 注册: 2014-08-23
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
6楼2014-08-27 14:25:35
