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shuangliwang铁杆木虫 (小有名气)
超级终结者
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有关生物大分子的计算，如何得到.wfn文件？ 已有3人参与
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前段时间对生物大分子进行计算，遇到了下面的问题，请大神指教： 1.从外文网站上下载了分子的.pdf文件 2.导入GaussianView加氢后，输出分子的坐标。 3.在工作站进行计算结束后，未得到所需的.wfn文件。<这一步未对分子未进行优化> 不知下步如何处理？ 下面是部分输出内容： ---------------------------------------- #B3LYP/6-31G* opt density nosymm out=wfn ---------------------------------------- 1/14=-1,18=20,19=15,26=3,38=1/1,3; 2/9=110,12=2,15=1,17=6,18=5,40=1/2; 3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3; 4//1; 5/5=2,38=5/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,22=-1,28=1,31=1/1; 7/30=1/1,2,3,16; 1/14=-1,18=20,19=15/3(2); 2/9=110,15=1/2; 99/6=1100/99; 2/9=110,15=1/2; 3/5=1,6=6,7=1,11=2,16=1,25=1,30=1,71=1,74=-5/1,2,3; 4/5=5,16=3/1; 5/5=2,38=5/2; 7/30=1/1,2,3,16; 1/14=-1,18=20,19=15/3(-5); 2/9=110,15=1/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,19=2,22=-1,28=1,31=1/1; 99/6=1100,9=1/99; ------ winter ------ Symbolic Z-matrix: Charge = 0 Multiplicity = 1 N -15.189 -11.394 -5.715 C -14.637 -10.165 -5.079 C -13.113 -10.218 -5.11 O -12.497 -11.126 -4.551 C -15.116 -10.081 -3.629 C -16.617 -9.815 -3.602 O -17.059 -8.693 -3.848 ............. Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Job cpu time: 1 days 5 hours 30 minutes 51.5 seconds. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Insufficient memory for a single shell combination in PrsMar called from Prism/PrismC: LenV= 1091693 MaxCom= -54 Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. Error termination via Lnk1e in /home/g03d01/G09_a01/g09/l502.exe at Mon Jun 30 21:57:56 2014. File lengths (MBytes): RWF= 36546 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1555 Scr= 1 谢谢！ |
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chu5263821
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