| 查看: 2530 | 回复: 17 | |||
missducksong铜虫 (小有名气)
|
[求助]
使用Multiwfn计算的乙醇体积和查到的数据偏差很大，求前辈解析原因！ 已有1人参与
|
||
|
1、本人使用Multiwfn计算出的乙醇体积为74.63736 angstromˆ3; 2、在网站http://www.basechem.org/chemical/1182查到的乙醇范德华体积为：31.940（cm3·mol-1）； 3、又单位换算：1 angstrom=0.1纳米； 算出的数据和网上查到的数据差别怎么这么大呢？这数据还能用吗？是哪边出问题了呢？求指导，谢谢！  乙醇数据.jpg |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 经验 |
» 猜你喜欢
哈尔滨工业大学（深圳）绿色化学团队招收2026年秋季入学博士生
已经有11人回复
-
澳大利亚昆士兰科技大学PhD博士奖学金
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有146人回复
-
【211博士招生】环境化学、地学、毒理方向，擅长污染物迁移转化降解、计算模拟者优先
已经有17人回复
-
求助如何利用vasp计算磁光克尔效应
已经有1人回复
-
070300总分298求调剂
已经有2人回复
-
一志愿厦门大学化学学硕307求调剂
已经有13人回复
-
理论与计算化学方向调剂——初试388分（数学144）
已经有1人回复
-
硕士研究生调剂
已经有0人回复
-
投稿期刊求助
已经有1人回复
-
江西师大化学工程学院调剂今晚0点开放！ 缺额100个，速冲！
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 使用Multiwfn基于完全态求和(SOS)方法计算极化率和超极化率
已经有8人回复
- 使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度
已经有18人回复
|
我来回答一下吧。。。 multiwfn算的是单个乙醇分子的体积。网上的数据是一摩尔乙醇分子的体积（注意那个mol^-1的单位）。 60.46545 angstrom^3 = 60.46545 x 10^-24 cm^3， 相当于60.46545 x 10^-24 x 6.022 x 10^23 cm^3 mol^-1 = 36.4 cm^3 mol^-1。与网上的31.9就相差不多了。考虑到单分子与凝聚态的差距，这个结果应该是合理的。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
missducksong12楼2014-05-27 23:27:49
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
missducksong: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 感谢指导，很有用！ 2014-05-26 17:41:05
感谢参与，应助指数 +1
missducksong: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 感谢指导，很有用！ 2014-05-26 17:41:05
|
有几个问题要注意 1 Multiwfn默认的电子密度0.001等值面定义的范德华表面是气相的，分子间没有接触、挤压，必然偏大。通常推荐用0.002等值面当成凝聚相的范德华体积 2 你查到的体积数据是具体怎么得来的，这得搞清楚。应该手动算一下是不是通过密度和分子质量换算来的。 3 假设你查到的就是换算而来的，Multiwfn算出来的与它也必然有差异。如《谈谈分子体积的计算》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/2707923863a0fd5b80f1a7df）所讨论的，从计算角度上来说，体积的定义本来就是含糊的，虽然0.002等值面是一种相对较为合理、有意义的定义，但这样得到的终究是单分子性质，只考虑单个分子自身。而查到的则是从分子凝聚相性质（密度）上换算来的。由于分子间复杂的相互作用，不可能那么简单地就很好对应上。但可以拟合个方程来将0.002等值面包围的体积和实验体积关联起来。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
2楼2014-05-26 15:07:21
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
5楼2014-05-26 21:10:35
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
8楼2014-05-26 23:21:35
10楼2014-05-27 00:11:18
14楼2014-05-30 04:14:26
sobereva
至尊木虫 (著名写手)
本人已永久离开小木虫
- QC强帖: 17
- 应助: 226 (大学生)
- 贵宾: 5.4
- 金币: 2180.5
- 红花: 217
- 帖子: 1241
- 在线: 366.8小时
- 虫号: 281271
- 注册: 2006-09-23
- 专业: 宇宙学
17楼2014-06-18 07:25:23
missducksong
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 516.1
- 红花: 1
- 帖子: 200
- 在线: 51.4小时
- 虫号: 2724595
- 注册: 2013-10-14
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
3楼2014-05-26 20:11:03
missducksong
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 516.1
- 红花: 1
- 帖子: 200
- 在线: 51.4小时
- 虫号: 2724595
- 注册: 2013-10-14
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
4楼2014-05-26 20:18:18
missducksong
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 516.1
- 红花: 1
- 帖子: 200
- 在线: 51.4小时
- 虫号: 2724595
- 注册: 2013-10-14
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
6楼2014-05-26 21:18:58
missducksong
铜虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 516.1
- 红花: 1
- 帖子: 200
- 在线: 51.4小时
- 虫号: 2724595
- 注册: 2013-10-14
- 专业: 工程热物理相关交叉领域
|
在0.002等值面下，使用multiwfn程序重新对乙醇（C2H6O）的分子表面进行了分析。 得出：(1)体积=60.46545angstromˆ3；(2)面积=82.42776angstromˆ2 这些值和在物竞化学品数据库http://www.basechem.org/chemical/1182查到的：——体积31.940（cm3·mol-1）——表面积4.930×109（cm2·mol-1） 虽说分子表面没有唯一定义，导致不同分子表面定义就会给出不同的分子体积定义，致使所计算出来的值和从数据库查到的值不能很好对应上，，，但这个差值的确还是挺大的哈。 如何拟合个方程来将0.002等值面包围的体积和实验体积关联起来呢？ 我现在使用的这种方法计算出来的体积值、面积值如果正确的话，能不能直接用于对这个乙醇分子的量化分析呢？ 还是说这个计算出来的值和数据库中的值差别比较大 一定要拟合个方程把其关联起来才能使用呢？ |
7楼2014-05-26 22:11:41
9楼2014-05-27 00:08:20
100