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missducksong铜虫 (小有名气)
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使用Multiwfn计算的乙醇体积和查到的数据偏差很大，求前辈解析原因！ 已有1人参与
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1、本人使用Multiwfn计算出的乙醇体积为74.63736 angstromˆ3; 2、在网站http://www.basechem.org/chemical/1182查到的乙醇范德华体积为：31.940（cm3·mol-1）； 3、又单位换算：1 angstrom=0.1纳米； 算出的数据和网上查到的数据差别怎么这么大呢？这数据还能用吗？是哪边出问题了呢？求指导，谢谢！  乙醇数据.jpg |
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我来回答一下吧。。。 multiwfn算的是单个乙醇分子的体积。网上的数据是一摩尔乙醇分子的体积（注意那个mol^-1的单位）。 60.46545 angstrom^3 = 60.46545 x 10^-24 cm^3， 相当于60.46545 x 10^-24 x 6.022 x 10^23 cm^3 mol^-1 = 36.4 cm^3 mol^-1。与网上的31.9就相差不多了。考虑到单分子与凝聚态的差距，这个结果应该是合理的。 |
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missducksong12楼2014-05-27 23:27:49
sobereva
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有几个问题要注意 1 Multiwfn默认的电子密度0.001等值面定义的范德华表面是气相的，分子间没有接触、挤压，必然偏大。通常推荐用0.002等值面当成凝聚相的范德华体积 2 你查到的体积数据是具体怎么得来的，这得搞清楚。应该手动算一下是不是通过密度和分子质量换算来的。 3 假设你查到的就是换算而来的，Multiwfn算出来的与它也必然有差异。如《谈谈分子体积的计算》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/2707923863a0fd5b80f1a7df）所讨论的，从计算角度上来说，体积的定义本来就是含糊的，虽然0.002等值面是一种相对较为合理、有意义的定义，但这样得到的终究是单分子性质，只考虑单个分子自身。而查到的则是从分子凝聚相性质（密度）上换算来的。由于分子间复杂的相互作用，不可能那么简单地就很好对应上。但可以拟合个方程来将0.002等值面包围的体积和实验体积关联起来。 |
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2楼2014-05-26 15:07:21
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5楼2014-05-26 21:10:35
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17楼2014-06-18 07:25:23
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3楼2014-05-26 20:11:03
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6楼2014-05-26 21:18:58
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在0.002等值面下，使用multiwfn程序重新对乙醇（C2H6O）的分子表面进行了分析。 得出：(1)体积=60.46545angstromˆ3；(2)面积=82.42776angstromˆ2 这些值和在物竞化学品数据库http://www.basechem.org/chemical/1182查到的：——体积31.940（cm3·mol-1）——表面积4.930×109（cm2·mol-1） 虽说分子表面没有唯一定义，导致不同分子表面定义就会给出不同的分子体积定义，致使所计算出来的值和从数据库查到的值不能很好对应上，，，但这个差值的确还是挺大的哈。 如何拟合个方程来将0.002等值面包围的体积和实验体积关联起来呢？ 我现在使用的这种方法计算出来的体积值、面积值如果正确的话，能不能直接用于对这个乙醇分子的量化分析呢？ 还是说这个计算出来的值和数据库中的值差别比较大 一定要拟合个方程把其关联起来才能使用呢？ |
7楼2014-05-26 22:11:41
9楼2014-05-27 00:08:20
