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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Multiwfn » 使用Multiwfn计算的乙醇体积和查到的数据偏差很大，求前辈解析原因！
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missducksong

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by tiechong at 2014-05-27 00:08:20
老弟，你的实验值是范德华体积，但是你却一直在算电子等值面，原则上讲这两者没有任何关系。如果你算出来有关联那才奇怪了（除非你的分子很特殊）...

额，前辈是这样，我不是在算电子等值面哈，我是在合适的电子等值面下算范德华体积的哈！(*^__^*)
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11楼2014-05-27 09:26:56
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recoli

金虫 (正式写手)
我来回答一下吧。。。
multiwfn算的是单个乙醇分子的体积。网上的数据是一摩尔乙醇分子的体积（注意那个mol^-1的单位）。
60.46545 angstrom^3 = 60.46545 x 10^-24 cm^3，
相当于60.46545 x 10^-24 x 6.022 x 10^23 cm^3 mol^-1 = 36.4 cm^3 mol^-1。与网上的31.9就相差不多了。考虑到单分子与凝聚态的差距，这个结果应该是合理的。
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missducksong
12楼2014-05-27 23:27:49
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missducksong

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
12楼: Originally posted by recoli at 2014-05-27 23:27:49
我来回答一下吧。。。
multiwfn算的是单个乙醇分子的体积。网上的数据是一摩尔乙醇分子的体积（注意那个mol^-1的单位）。
60.46545 angstrom^3 = 60.46545 x 10^-24 cm^3，
相当于60.46545 x 10^-24 x 6.022 x 1 ...

非常感谢前辈的指导，感恩。前辈，是不是我算出来的所有体积值都需x 6.022 x 10^23 cm^3 mol^-1呢？
那算出的分子面积（单位是angstrom^2）应该×多少--转换成cm^2，又×多少--转化×cm^2 mol^-1呢？
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13楼2014-05-28 21:34:44
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recoli

金虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by missducksong at 2014-05-28 21:34:44
非常感谢前辈的指导，感恩。前辈，是不是我算出来的所有体积值都需x 6.022 x 10^23 cm^3 mol^-1呢？
那算出的分子面积（单位是angstrom^2）应该×多少--转换成cm^2，又×多少--转化×cm^2 mol^-1呢 ...

1) 6.022 x 10^23 mol^-1 是阿伏伽德罗常数，乘上它是为了把单位cm^3转换为cm^3 mol^-1，以便和实验值比较。
2) 聚集态分子的表面积不能相加。
3) 如何展示数据要看你的具体需求。
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14楼2014-05-30 04:14:26
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missducksong

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by recoli at 2014-05-30 04:14:26
1) 6.022 x 10^23 mol^-1 是阿伏伽德罗常数，乘上它是为了把单位cm^3转换为cm^3 mol^-1，以便和实验值比较。
2) 聚集态分子的表面积不能相加。
3) 如何展示数据要看你的具体需求。...

好的，谢谢
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15楼2014-05-31 09:18:38
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missducksong

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-05-26 15:07:21
有几个问题要注意
1 Multiwfn默认的电子密度0.001等值面定义的范德华表面是气相的，分子间没有接触、挤压，必然偏大。通常推荐用0.002等值面当成凝聚相的范德华体积
2 你查到的体积数据是具体怎么得来的，这得搞清 ...

敬爱的前辈，在拟合个方程来将0.002等值面包围的体积和实验体积关联起来时，所拟合的方程（如线性的y=ax形式方程）是在Multiwfn计算时输入到程序中呢，还是计算结果出来之后自己手动统一把计算结果和这个方程联立呢？
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16楼2014-06-17 20:35:25
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
16楼: Originally posted by missducksong at 2014-06-17 20:35:25
敬爱的前辈，在拟合个方程来将0.002等值面包围的体积和实验体积关联起来时，所拟合的方程（如线性的y=ax形式方程）是在Multiwfn计算时输入到程序中呢，还是计算结果出来之后自己手动统一把计算结果和这个方程联立呢 ...

用Multiwfn算出来体积后，通过origin之类程序去和实验值拟合
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17楼2014-06-18 07:25:23
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missducksong

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
17楼: Originally posted by sobereva at 2014-06-18 07:25:23
用Multiwfn算出来体积后，通过origin之类程序去和实验值拟合...

好的，谢谢前辈，(*^__^*)
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18楼2014-06-18 09:46:55
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