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bswhan

铜虫 (初入文坛)

[求助] 基因组跑胶已有4人参与

求助我的基因组跑成这样是啥原因啊?之前提的没有问题,近期老是这样,PCR也会出现杂带,望大神帮帮忙,谢谢

基因组跑胶
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a50044758

银虫 (小有名气)

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★ ★ ★ ★ ★
bswhan(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-17 20:29:23
bswhan: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-08-29 15:48:35
引用回帖:
4楼: Originally posted by bswhan at 2014-08-15 10:29:24
你好,我是用试剂盒提的基因组,之前的操作都没有换过,你说的酚仿抽提具体的操作,能详细告诉我吗...

一般用的是酚:氯仿:异丙醇为25:24:1(v/v),和提的基因组DNA等体积混合,10000转离心5min,取上清,重复一次,向上清中加入1/10体积的3M pH=5.2的醋酸钠,再加入2.5倍体积纯酒精,-20度冰冻1h,14000r/min冷冻离心10min,得到的沉淀就是你的DNA,把沉淀DNA用70%的酒精洗2遍,挥发酒精后的基因组DNA纯度就很高了!
7楼2014-08-15 15:59:41
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a50044758

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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bswhan(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-08-15 13:00:15
基因组不纯,因为你的Marker正常,但是基因组有拖尾,里面的蛋白,多糖没除干净,你把你的基因组用酚仿抽提几遍就好了!

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2楼2014-08-15 01:16:17
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小豆子J

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
bswhan(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-08-15 13:00:26
之前提的没有问题,说明操作上问题不大,那就可能是菌体老化或者提取试剂出了问题,试剂的问题多数会出在菌体裂解部分。

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3楼2014-08-15 08:57:43
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bswhan

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by a50044758 at 2014-08-15 01:16:17
基因组不纯,因为你的Marker正常,但是基因组有拖尾,里面的蛋白,多糖没除干净,你把你的基因组用酚仿抽提几遍就好了!

你好,我是用试剂盒提的基因组,之前的操作都没有换过,你说的酚仿抽提具体的操作,能详细告诉我吗
4楼2014-08-15 10:29:24
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bswhan

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小豆子J at 2014-08-15 08:57:43
之前提的没有问题,说明操作上问题不大,那就可能是菌体老化或者提取试剂出了问题,试剂的问题多数会出在菌体裂解部分。

菌体老化,我这边用的菌应该30度培养,我37度培养的,12个小时后用的,影响会很大吗?裂解剂我用的自己配的溶菌酶,也是刚配的,问题应该不是很大。我用这次的基因组PCR产物,除了主带,还有好几个条带,之前没有这样的问题的,我应该从哪里找原因呢
5楼2014-08-15 10:32:16
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happydove

新虫 (小有名气)

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bswhan(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-15 13:00:39
你好!从图上看,点样空位置很干净,你有没有测OD値?
PCR产物有问题,引物用的是以前的吗?
你没有阳性对照,阳性对照PCR结果怎么样?
6楼2014-08-15 11:15:56
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bswhan

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by a50044758 at 2014-08-15 15:59:41
一般用的是酚:氯仿:异丙醇为25:24:1(v/v),和提的基因组DNA等体积混合,10000转离心5min,取上清,重复一次,向上清中加入1/10体积的3M pH=5.2的醋酸钠,再加入2.5倍体积纯酒精,-20度冰冻1h,14000r/min冷冻 ...

非常感谢
8楼2014-08-15 18:48:17
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nl2016

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个基因组DNA提的挺好的呀,就是样品浓度太高了!
PCR有杂带,建议适当稀释DNA模板后再做PCR!

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9楼2014-08-16 10:02:57
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bswhan

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by a50044758 at 2014-08-15 15:59:41
一般用的是酚:氯仿:异丙醇为25:24:1(v/v),和提的基因组DNA等体积混合,10000转离心5min,取上清,重复一次,向上清中加入1/10体积的3M pH=5.2的醋酸钠,再加入2.5倍体积纯酒精,-20度冰冻1h,14000r/min冷冻 ...

大侠,可以留个联系方式吗?初入分子,实在不懂,谢谢
10楼2014-08-16 20:31:47
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