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猫猫守卫者

银虫 (小有名气)

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[求助] 高斯小白求教。已有1人参与

就是，在拿到一篇文献的时候里面已经有前人用Gaussian做出来的数据,现在想再利用Gaussian验证一下，但是第一步就是要用GaussView画出对应分子，这对应分子应该怎样画出来啊？例如，老师走之前给我拿本书里面老师写的论文中用到的多溴代联苯醚以及产物分子。是要自己根据分子结构自己做出来的么？

还有就是，做Gaussian计算第一步就是要对化合物分子进行结构优化。但是我不清楚的是，比如一个化合物分子用Gaussian做好了结构优化计算以后，后续就是在这个分子基础上再做其他的计算。问题就是，每当Gaussian计算完以后分子状态是不是就不再是初始状态了？输出文件最后保存的就是终态吧。那在进行下一个计算的时候应该怎样进行了？是计算时再继续调用前面的输出文件里面的信息么？还是怎么的？

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实力造就经典，王者绝非偶然。。

1楼 2014-08-14 16:48:01

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李加伟

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【答案】应助回帖

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就是，在拿到一篇文献的时候里面已经有前人用Gaussian做出来的数据,现在想再利用Gaussian验证一下，但是第一步就是要用GaussView画出对应分子，这对应分子应该怎样画出来啊？例如，老师走之前给我拿本书里面老师写的论文中用到的多溴代联苯醚以及产物分子。是要自己根据分子结构自己做出来的么？
是的，高斯里面一般都没有这些复杂的分子式，简单的一些都有，这个你看看说明书就知道了，不需要来问

还有就是，做Gaussian计算第一步就是要对化合物分子进行结构优化。但是我不清楚的是，比如一个化合物分子用Gaussian做好了结构优化计算以后，后续就是在这个分子基础上再做其他的计算。问题就是，每当Gaussian计算完以后分子状态是不是就不再是初始状态了？输出文件最后保存的就是终态吧。那在进行下一个计算的时候应该怎样进行了？是计算时再继续调用前面的输出文件里面的信息么？还是怎么的？
优化完成后的结构是根据能量或者其他原理的最优化的结构（比如能量最低），你的计算也必须依着这个开始的，后续的计算要看你是在优化完的第一种结构之间计算，还是算了其他的东西之后再做的计算了，要是重新开始算另外一种情况，肯定要保留原来的优化结构再重新算

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