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猫猫守卫者

银虫 (小有名气)

[求助] 高斯小白求教。 已有1人参与

就是，在拿到一篇文献的时候里面已经有前人用Gaussian做出来的数据,现在想再利用Gaussian验证一下，但是第一步就是要用GaussView画出对应分子，这对应分子应该怎样画出来啊？例如，老师走之前给我拿本书里面老师写的论文中用到的 多溴代联苯醚以及产物分子。 是要自己根据分子结构自己做出来的么？

      还有就是，做Gaussian计算第一步就是要对化合物分子进行结构优化。但是我不清楚的是，比如一个化合物分子用Gaussian做好了结构优化计算以后，后续就是在这个分子基础上再做其他的计算。问题就是，每当Gaussian计算完以后分子状态是不是就不再是初始状态了？输出文件最后保存的就是终态吧。那在进行下一个计算的时候应该怎样进行了？是计算时再继续调用前面的输出文件里面的信息么？还是怎么的？
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实力造就经典，王者绝非偶然。。
1楼 2014-08-14 16:48:01
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李加伟

荣誉版主 (文坛精英)

不过凡人

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
就是，在拿到一篇文献的时候里面已经有前人用Gaussian做出来的数据,现在想再利用Gaussian验证一下，但是第一步就是要用GaussView画出对应分子，这对应分子应该怎样画出来啊？例如，老师走之前给我拿本书里面老师写的论文中用到的 多溴代联苯醚以及产物分子。 是要自己根据分子结构自己做出来的么？
是的，高斯里面一般都没有这些复杂的分子式，简单的一些都有，这个你看看说明书就知道了，不需要来问

      还有就是，做Gaussian计算第一步就是要对化合物分子进行结构优化。但是我不清楚的是，比如一个化合物分子用Gaussian做好了结构优化计算以后，后续就是在这个分子基础上再做其他的计算。问题就是，每当Gaussian计算完以后分子状态是不是就不再是初始状态了？输出文件最后保存的就是终态吧。那在进行下一个计算的时候应该怎样进行了？是计算时再继续调用前面的输出文件里面的信息么？还是怎么的？
优化完成后的结构是根据能量或者其他原理的最优化的结构（比如能量最低），你的计算也必须依着这个开始的，后续的计算要看你是在优化完的第一种结构之间计算，还是算了其他的东西之后再做的计算了，要是重新开始算另外一种情况，肯定要保留原来的优化结构再重新算
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人生海海，在于内心
2楼2014-08-14 17:24:06
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