24小时热门版块排行榜    

查看: 1512  |  回复: 7

Fish__bone

金虫 (小有名气)

[求助] Run AutoDock 之后autodock4: creating docking log file ind.dlg,求大神指教 已有2人参与

Run AutoDock 之后MGLTools最终只显示Running: autodock4 -p ind2.dpf
autodock4: creating docking log file ind2.dlg
并且完成后,MGLTools的对话框(2.png)中的“OK”也是可以点击的,点击之后对话框也消失了,运算也完成了,但是ind2.dlg用记事本打开后,只有autodock4: creating docking log file C:\\Users\\tommy\\ind.dlg这一行文字,没有结果
求大神指教,为我指出一条明路!

Run AutoDock 之后autodock4: creating docking log file ind.dlg,求大神指教
1.png


Run AutoDock 之后autodock4: creating docking log file ind.dlg,求大神指教-1
2.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
重新构建box,然后autogrid和autodock
2楼2014-08-06 22:42:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-06 22:42:38
重新构建box,然后autogrid和autodock

autodockytu您好!那个grid box我只是设置了那个60、60、60其他的都是默认的,这其中哪里出了什么问题啊?
3楼2014-08-07 16:21:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-06 22:42:38
重新构建box,然后autogrid和autodock

autodockytu您好!那个grid box我只是设置了那个60、60、60其他的都是默认的,这其中哪里出了什么问题啊?
4楼2014-08-07 16:53:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by Fish__bone at 2014-08-07 16:21:14
autodockytu您好!那个grid box我只是设置了那个60、60、60其他的都是默认的,这其中哪里出了什么问题啊?...

盒子的位置是否设置合理?对接的时候盒子的位置设置比较重要,直接关系你的对接结果
5楼2014-08-07 18:40:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-07 18:40:26
盒子的位置是否设置合理?对接的时候盒子的位置设置比较重要,直接关系你的对接结果...

不知道是什么原因,后来我重新设置box的xyz值,第一次出现了正常的结果,按原来步骤再次试的时候就跟原来的问题一样了,不出现结果了。怎么会有这种戏剧性的变化??
跟Run AutoDock中的program pathname、parameter pathname等路径有关系吗??
恳请大神指教啊!!
6楼2014-08-07 22:15:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-07 18:40:26
盒子的位置是否设置合理?对接的时候盒子的位置设置比较重要,直接关系你的对接结果...

大哥,在下纯学生一枚,做设计要用到这个软件,被这个问题困扰整整两个星期了,小木虫金币全数献上,请帮忙解决一下,感谢!!!
7楼2014-08-07 22:22:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phaeton193

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我觉得你们应该再试试看其他的box位点
8楼2014-08-11 20:26:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Fish__bone 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +19 医学老男孩 2026-08-13 42/2100 2026-08-14 12:56 by Vivilian
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
信息提示
请填处理意见