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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Fish__bone

金虫 (小有名气)

[求助] Run AutoDock 之后autodock4: creating docking log file ind.dlg,求大神指教 已有2人参与

Run AutoDock 之后MGLTools最终只显示Running: autodock4 -p ind2.dpf
autodock4: creating docking log file ind2.dlg
并且完成后,MGLTools的对话框(2.png)中的“OK”也是可以点击的,点击之后对话框也消失了,运算也完成了,但是ind2.dlg用记事本打开后,只有autodock4: creating docking log file C:\\Users\\tommy\\ind.dlg这一行文字,没有结果
求大神指教,为我指出一条明路!

Run AutoDock 之后autodock4: creating docking log file ind.dlg,求大神指教
1.png


Run AutoDock 之后autodock4: creating docking log file ind.dlg,求大神指教-1
2.png
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
重新构建box,然后autogrid和autodock
2楼2014-08-06 22:42:38
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Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-06 22:42:38
重新构建box,然后autogrid和autodock

autodockytu您好!那个grid box我只是设置了那个60、60、60其他的都是默认的,这其中哪里出了什么问题啊?
3楼2014-08-07 16:21:14
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Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-06 22:42:38
重新构建box,然后autogrid和autodock

autodockytu您好!那个grid box我只是设置了那个60、60、60其他的都是默认的,这其中哪里出了什么问题啊?
4楼2014-08-07 16:53:33
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by Fish__bone at 2014-08-07 16:21:14
autodockytu您好!那个grid box我只是设置了那个60、60、60其他的都是默认的,这其中哪里出了什么问题啊?...

盒子的位置是否设置合理?对接的时候盒子的位置设置比较重要,直接关系你的对接结果
5楼2014-08-07 18:40:26
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Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-07 18:40:26
盒子的位置是否设置合理?对接的时候盒子的位置设置比较重要,直接关系你的对接结果...

不知道是什么原因,后来我重新设置box的xyz值,第一次出现了正常的结果,按原来步骤再次试的时候就跟原来的问题一样了,不出现结果了。怎么会有这种戏剧性的变化??
跟Run AutoDock中的program pathname、parameter pathname等路径有关系吗??
恳请大神指教啊!!
6楼2014-08-07 22:15:51
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Fish__bone

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by autodockytu at 2014-08-07 18:40:26
盒子的位置是否设置合理?对接的时候盒子的位置设置比较重要,直接关系你的对接结果...

大哥,在下纯学生一枚,做设计要用到这个软件,被这个问题困扰整整两个星期了,小木虫金币全数献上,请帮忙解决一下,感谢!!!
7楼2014-08-07 22:22:31
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phaeton193

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我觉得你们应该再试试看其他的box位点
8楼2014-08-11 20:26:27
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