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关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结 已有4人参与
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查了网上的相关资料，但是没有解决本人的疑惑，这里向大家求助，谢谢！ 1、编码区与CDS是同一个概念吗？因为编码区包含内含子和外显子，但是cds只包含起始密码到终止密码的序列，所以应该不是同一个概念吧？ 2、CDS与开放阅读框的区别？查了网上的相关资料，但是仍旧有疑问，为什么CDS可以包括很多个开放阅读框？ |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2014-08-01 23:46:20
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gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2014-08-01 23:46:20
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不。ORF不是CDS。 CDS的定义是对的，即CDS是已知的一个基因上确确实实翻译成蛋白质的区段。 ORF则是指，任意一段序列，只要起于ATG止于终止子，都可以叫做ORF。ORF是一种预测，而不是一种已知的翻译区。即随意写下一段DNA序列，只要以三个碱基为单位能找到ATG和终止子，就可以称作ORF，这段ORF甚至可能不是一段真正存在的DNA序列，但是它仍然是ORF。一段序列是可以有多个ORF的，只有当ORF符合已知的可翻译成蛋白的序列时，才能等同于CDS。 |
10楼2014-08-01 18:13:06
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-08-01 23:46:00
lmc2537: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-08-02 11:03:33
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-08-01 23:46:00
lmc2537: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-08-02 11:03:33
 图片来自wiki 图中序列为 ATGCAATGGGGAAATGTTACCAGGTCCGAACTTATTGAGGTAAGACAGATTTAA 假设这是某种基因的CDS。那么在这段序列中，由图所示，会出现三种始于ATG终于终止子的片段，由于这三种都有可能翻译成氨基酸，所以你可以说这段序列有三种可能的ORF。但是在基因中真正翻译出来的只有1，那么当你说这段基因的CDS的时候，只能是1. |
13楼2014-08-01 20:36:56
14楼2014-08-01 20:46:45