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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结
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lmc2537

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结 已有4人参与

查了网上的相关资料，但是没有解决本人的疑惑，这里向大家求助，谢谢！

1、编码区与CDS是同一个概念吗？因为编码区包含内含子和外显子，但是cds只包含起始密码到终止密码的序列，所以应该不是同一个概念吧？

2、CDS与开放阅读框的区别？查了网上的相关资料，但是仍旧有疑问，为什么CDS可以包括很多个开放阅读框？
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1楼 2014-07-31 17:58:35
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usky_4

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-08-01 23:46:00
lmc2537: 金币+2, ★★★很有帮助 2014-08-02 11:03:33
引用回帖:
12楼: Originally posted by lmc2537 at 2014-08-01 19:25:19
谢谢你的解答，那么CDS可包括多个ORF这句话怎么理解呢？因为按你所说ORF包括ATG和终止子，CDS也是包括ATG和终止子的，那么CDS为什么可以包括多个ORF?...

关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结

图片来自wiki

图中序列为
ATGCAATGGGGAAATGTTACCAGGTCCGAACTTATTGAGGTAAGACAGATTTAA

假设这是某种基因的CDS。那么在这段序列中，由图所示，会出现三种始于ATG终于终止子的片段，由于这三种都有可能翻译成氨基酸，所以你可以说这段序列有三种可能的ORF。但是在基因中真正翻译出来的只有1，那么当你说这段基因的CDS的时候，只能是1.
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下次再见面的时候，我们一定会笑着相遇吧
13楼2014-08-01 20:36:56
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-31 20:10:37
1.编码区就是CDS！编码区是中文名，不含内含子，CDS是英文缩写，两者所指内容是一样的。mRNA是包含了起始密码子前和终止密码子后的序列的，估计你把编码区理解成mRNA了。
2.开放阅读框有点类似于外显子。
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2楼2014-07-31 19:39:00
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lmc2537(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-01 10:32:22
1. 基因的编码区(Coding region），亦称为“编码序列”（Coding sequence）或“CDS”（Coding DNA Sequence），是指mRNA序列中编码蛋白质的那部分序列。
以上几个术语对应的是同一段序列，无论是在mRNA层面还是在含有内含子的DNA序列层面理解

2. CDS也等同于ORF（open reading frame）是编码蛋白质的序列，以ATG开始--终止密码子结束。
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2014-07-31 20:17:26
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lmc2537

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-07-31 19:39:00
1.编码区就是CDS！编码区是中文名，不含内含子，CDS是英文缩写，两者所指内容是一样的。mRNA是包含了起始密码子前和终止密码子后的序列的，估计你把编码区理解成mRNA了。
2.开放阅读框有点类似于外显子。

我的理解是基因包括编码区和非编码区，其中编码区包括内含子和外显子，也就是能够转录成hnRNA的部分，而CDS与编码区感觉不是同一个概念，编码区的概念应该比CDS更大，CDS为编码序列，即mRNA的中间部分，而编码区显然大于mRNA，所以编码区包含了编码序列。
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4楼2014-07-31 22:15:22
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