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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 我有一个蛋白氨基酸多序列比对的结果，怎么做做氨基酸共进化分析？啊虫友帮助我啊！
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wq242424

木虫 (小有名气)

[求助] 我有一个蛋白氨基酸多序列比对的结果，怎么做做氨基酸共进化分析？啊虫友帮助我啊！已有2人参与

前几天做了一个多序列比对，想用来做共进化分析，但是由于我是初入生物信息，好多都还不懂呢。。这几天想用matlab-SCA做，但是真心不懂，不会啊，求大神帮助，现在我只有比对好的序列，接下来需要做什么工作，或者是有什么更好的共进化分析软件，大神分享下，教教我吧，最好有教程什么的，谢谢啦！
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自己努力，没有跨不过的坎，没有迈不过的河！相信自己！！
1楼2014-07-30 17:08:27
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快乐君子

银虫 (小有名气)
我也是新手，两星期以前，我学过pearson相关系数的分析，用Graphviz画基因表达相关性图。共进化分析还不是很懂。
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Youcangoasfarasyouwanttogo.
2楼2014-08-15 21:03:42
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czcpudai

铜虫 (正式写手)
求教 多序列比对是如何做的？
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3楼2014-08-17 16:22:46
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匿名

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4楼2014-08-18 02:19:03
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czcpudai

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by louis_cheung at 2014-08-18 02:19:03
可用现成的软件，或自己知道算法写个程序算~
...

我理解的是  在NCBI上分别找出各个蛋白的序列，写成FATAS的格式，然后用DNAstar进行分析，就是把多个蛋白序列的文件给打开，然后按照相应的操作来即可？不知道这样子是不是对的，第一次遇到这种问题，还希望不要见效啊
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5楼2014-08-18 21:38:06
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匿名

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6楼2014-08-19 00:47:23
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wendijian

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wq242424: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-07-08 11:51:27
Protein Sectors: Evolutionary Units of Three-Dimensional Structure
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7楼2015-07-08 11:51:09
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