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xujingyuanxu铜虫 (正式写手)
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ISSR分子标记中用Popgene计算相关参数时样本量的问题 已有1人参与
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| 本人第一次做分子标记，从开始到现在已经一年了，最近两天准备用Popgene处理数据的时候才发现了很严重的问题，想请教一下：我在25个不同的地区采相同的植物来做分子标记，每次PCR的时候用一个引物对这25个地区的植物模板进行扩增，然后25个不同样品放在一块胶上跑，之后就是看胶，数条带（这里是要将这25个不同地区看成是25个population么？）。可是最近要参照文献要处理数据时才发现用POPGene算一些数据时每个population里不止一个sample。将我现在得到的胶图结合在一起，我发现自己好像是每个population里面只有一个sample，这样是不是就因为每个population中的sample太少而没法用Popgene来算一系列的参数了啊？是不是得把所有的样品每个个体都用筛选出的引物扩增跑胶啊？ 我是药学专业的，对标记以及相关参数代表什么意思是一点也不懂，做到现在快毕业了突然发现好像自己做错了，悔的都快吐血了，怨自己没看好文献！希望大神给指条明路看看接下来这数据该怎么处理！谢谢了！ |
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10楼2015-06-03 15:28:14
皇猪
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【答案】应助回帖
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xujingyuanxu: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-09-03 09:59:56
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2014-09-03 18:47:53
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| population的划分应研究而定，有的人以一个省的为一个种群，而有的人以一个市的为一个种群，这主要看你的研究目的了。。。一个种群只有一个样本，少了些，多做几个样本吧！！！如果没时间采样本了，就把25个样当做一个种群处理呗，这样用popgene就能计算出遗传参数了，不过只能计算单一种群的参数，像基因流、Gst、遗传距离等没法算了 |
2楼2014-09-02 21:48:00
xujingyuanxu
铜虫 (正式写手)
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10