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xujingyuanxu

铜虫 (正式写手)

[求助] ISSR分子标记中用Popgene计算相关参数时样本量的问题 已有1人参与

本人第一次做分子标记,从开始到现在已经一年了,最近两天准备用Popgene处理数据的时候才发现了很严重的问题,想请教一下:我在25个不同的地区采相同的植物来做分子标记,每次PCR的时候用一个引物对这25个地区的植物模板进行扩增,然后25个不同样品放在一块胶上跑,之后就是看胶,数条带(这里是要将这25个不同地区看成是25个population么?)。可是最近要参照文献要处理数据时才发现用POPGene算一些数据时每个population里不止一个sample。将我现在得到的胶图结合在一起,我发现自己好像是每个population里面只有一个sample,这样是不是就因为每个population中的sample太少而没法用Popgene来算一系列的参数了啊?是不是得把所有的样品每个个体都用筛选出的引物扩增跑胶啊? 我是药学专业的,对标记以及相关参数代表什么意思是一点也不懂,做到现在快毕业了突然发现好像自己做错了,悔的都快吐血了,怨自己没看好文献!希望大神给指条明路看看接下来这数据该怎么处理!谢谢了!
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xujingyuanxu

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 皇猪 at 2014-09-02 21:48:00
population的划分应研究而定,有的人以一个省的为一个种群,而有的人以一个市的为一个种群,这主要看你的研究目的了。。。一个种群只有一个样本,少了些,多做几个样本吧!!!如果没时间采样本了,就把25个样当做一 ...

谢谢帮助!
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3楼2014-09-03 10:00:19
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