24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2202  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xujingyuanxu

铜虫 (正式写手)

[求助] ISSR分子标记中用Popgene计算相关参数时样本量的问题已有1人参与

本人第一次做分子标记,从开始到现在已经一年了,最近两天准备用Popgene处理数据的时候才发现了很严重的问题,想请教一下:我在25个不同的地区采相同的植物来做分子标记,每次PCR的时候用一个引物对这25个地区的植物模板进行扩增,然后25个不同样品放在一块胶上跑,之后就是看胶,数条带(这里是要将这25个不同地区看成是25个population么?)。可是最近要参照文献要处理数据时才发现用POPGene算一些数据时每个population里不止一个sample。将我现在得到的胶图结合在一起,我发现自己好像是每个population里面只有一个sample,这样是不是就因为每个population中的sample太少而没法用Popgene来算一系列的参数了啊?是不是得把所有的样品每个个体都用筛选出的引物扩增跑胶啊? 我是药学专业的,对标记以及相关参数代表什么意思是一点也不懂,做到现在快毕业了突然发现好像自己做错了,悔的都快吐血了,怨自己没看好文献!希望大神给指条明路看看接下来这数据该怎么处理!谢谢了!
回复此楼
我努力,我坚持,我成功!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ly1152913266

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 皇猪 at 2014-12-11 08:57:38
个人理解为:只要是同一个引物的loci,其数目在你所取样品中的loci数目都是一致的,也就是说若引物E在研究样品中共扩增出m条带,通过电泳发现有n条带处于不同的迁移位置上,那么该引物E所对应的样本的loci数就是n, ...

大神你好,我想请教一个问题!
我想算每个引物的Na、Ne等,但是用popgene出来的都是每个位点的。
10楼2015-06-03 15:28:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xujingyuanxu 的主题更新
信息提示
请填处理意见