24小时热门版块排行榜    

查看: 3576  |  回复: 8

shaserena

新虫 (小有名气)

[求助] 有关LJ势,chemrate选项的问题 已有1人参与

用MS Dmol3搜索完过渡态以后,利用chemrate计算Arrhenius equation里面的A n E。可是在输入反应物、过渡态的有关参数时涉及到有一栏是collision model,里面需要填写反应物、过渡态、以及两者与惰性气体间的LJ势参数sigma,epsilon。如图一:

点开compute键会出现如下图3对话框:可以用临界压力、临界温度、偏心因子计算出sigma和epsilon

点开properties,会出现图2右边对话框,需要选择反应物与惰性气体间碰撞模型,并给出参数alpha0



我的问题是:用MS Dmol3计算反应过渡态时并未涉及势的问题。这里计算Arrhenius equation里面的A n E突然让填势参数,这个势参数对计算A n E有没有影响?是否可以去除?另外惰性气体可否也去除,100%是反应物?这样就不用填这个LJ参数了吧?

如果有影响需要填的话,是如何影响的呢?分子的sigma,epsilon又是如何得来呢?以苯分子为例,可以这样算吗:sigmaC6H6=1/2*(6sigmaC+6sigmaH),epsilonC6H6又怎么算呢?
或者有那位知道可以得到物质(比如:C6H5、C2H3之类的)的临界温度,临界压力,偏心因子的?

有关LJ势,chemrate选项的问题
1.JPG


有关LJ势,chemrate选项的问题-1
2.JPG


有关LJ势,chemrate选项的问题-2
3.JPG
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

多孔材料

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

顶起来
2楼2014-07-08 14:27:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-07-16 16:26:54
纯物质的临界参数都是可以查到的,对于LJ分子势能阐述,需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
3楼2014-07-09 09:01:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by polypro at 2014-07-09 09:01:59
纯物质的临界参数都是可以查到的,对于LJ分子势能阐述,需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来

"需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来"
可否详细讲一下?
4楼2014-07-10 09:40:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

★ ★
shaserena(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流! 2014-07-16 16:27:01
引用回帖:
4楼: Originally posted by shaserena at 2014-07-10 09:40:44
"需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来"
可否详细讲一下?...

你可以用这篇文献中的办法,比较简单直接
J Chem Theory Comput. Aug 11, 2009; 5(8): 2115–2124.
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
5楼2014-07-10 17:15:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

顶一下
6楼2014-07-14 10:50:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

顶一下
7楼2014-07-18 20:55:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiewei娜

银虫 (小有名气)

送红花一朵
请问楼主知道怎么搜索outmol文件中的反应能量和能量势垒吗,有现成的数值可以直接看的吗,具体是搜索什么可以得到这两个值呢?本人刚学,好多不懂。
8楼2015-07-11 16:08:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xiewei娜 at 2015-07-11 16:08:37
请问楼主知道怎么搜索outmol文件中的反应能量和能量势垒吗,有现成的数值可以直接看的吗,具体是搜索什么可以得到这两个值呢?本人刚学,好多不懂。

我现在不用MS了,改用高斯了早就
9楼2015-07-14 08:37:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shaserena 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 281求调剂(0805) +3 烟汐忆海 2026-03-16 8/400 2026-03-18 00:47 by 烟汐忆海
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 299求调剂 +4 △小透明* 2026-03-17 4/200 2026-03-17 20:09 by peike
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +4 梨花珞晚风 2026-03-17 4/200 2026-03-17 13:38 by houyaoxu
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 0856材料与化工301求调剂 +5 奕束光 2026-03-13 5/250 2026-03-13 22:00 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
信息提示
请填处理意见