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shaserena

新虫 (小有名气)

[求助] 有关LJ势,chemrate选项的问题 已有1人参与

用MS Dmol3搜索完过渡态以后,利用chemrate计算Arrhenius equation里面的A n E。可是在输入反应物、过渡态的有关参数时涉及到有一栏是collision model,里面需要填写反应物、过渡态、以及两者与惰性气体间的LJ势参数sigma,epsilon。如图一:

点开compute键会出现如下图3对话框:可以用临界压力、临界温度、偏心因子计算出sigma和epsilon

点开properties,会出现图2右边对话框,需要选择反应物与惰性气体间碰撞模型,并给出参数alpha0



我的问题是:用MS Dmol3计算反应过渡态时并未涉及势的问题。这里计算Arrhenius equation里面的A n E突然让填势参数,这个势参数对计算A n E有没有影响?是否可以去除?另外惰性气体可否也去除,100%是反应物?这样就不用填这个LJ参数了吧?

如果有影响需要填的话,是如何影响的呢?分子的sigma,epsilon又是如何得来呢?以苯分子为例,可以这样算吗:sigmaC6H6=1/2*(6sigmaC+6sigmaH),epsilonC6H6又怎么算呢?
或者有那位知道可以得到物质(比如:C6H5、C2H3之类的)的临界温度,临界压力,偏心因子的?

有关LJ势,chemrate选项的问题
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有关LJ势,chemrate选项的问题-1
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有关LJ势,chemrate选项的问题-2
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xiewei娜

银虫 (小有名气)

送红花一朵
请问楼主知道怎么搜索outmol文件中的反应能量和能量势垒吗,有现成的数值可以直接看的吗,具体是搜索什么可以得到这两个值呢?本人刚学,好多不懂。
8楼2015-07-11 16:08:37
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