24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3619  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

[求助] 有关LJ势,chemrate选项的问题 已有1人参与

用MS Dmol3搜索完过渡态以后,利用chemrate计算Arrhenius equation里面的A n E。可是在输入反应物、过渡态的有关参数时涉及到有一栏是collision model,里面需要填写反应物、过渡态、以及两者与惰性气体间的LJ势参数sigma,epsilon。如图一:

点开compute键会出现如下图3对话框:可以用临界压力、临界温度、偏心因子计算出sigma和epsilon

点开properties,会出现图2右边对话框,需要选择反应物与惰性气体间碰撞模型,并给出参数alpha0



我的问题是:用MS Dmol3计算反应过渡态时并未涉及势的问题。这里计算Arrhenius equation里面的A n E突然让填势参数,这个势参数对计算A n E有没有影响?是否可以去除?另外惰性气体可否也去除,100%是反应物?这样就不用填这个LJ参数了吧?

如果有影响需要填的话,是如何影响的呢?分子的sigma,epsilon又是如何得来呢?以苯分子为例,可以这样算吗:sigmaC6H6=1/2*(6sigmaC+6sigmaH),epsilonC6H6又怎么算呢?
或者有那位知道可以得到物质(比如:C6H5、C2H3之类的)的临界温度,临界压力,偏心因子的?

有关LJ势,chemrate选项的问题
1.JPG


有关LJ势,chemrate选项的问题-1
2.JPG


有关LJ势,chemrate选项的问题-2
3.JPG
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

多孔材料

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xiewei娜 at 2015-07-11 16:08:37
请问楼主知道怎么搜索outmol文件中的反应能量和能量势垒吗,有现成的数值可以直接看的吗,具体是搜索什么可以得到这两个值呢?本人刚学,好多不懂。

我现在不用MS了,改用高斯了早就
9楼2015-07-14 08:37:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-07-16 16:26:54
纯物质的临界参数都是可以查到的,对于LJ分子势能阐述,需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
3楼2014-07-09 09:01:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shaserena

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by polypro at 2014-07-09 09:01:59
纯物质的临界参数都是可以查到的,对于LJ分子势能阐述,需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来

"需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来"
可否详细讲一下?
4楼2014-07-10 09:40:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

★ ★
shaserena(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流! 2014-07-16 16:27:01
引用回帖:
4楼: Originally posted by shaserena at 2014-07-10 09:40:44
"需要从原子势能阐述累加出分子间LJ势能曲线,进而拟合得来"
可否详细讲一下?...

你可以用这篇文献中的办法,比较简单直接
J Chem Theory Comput. Aug 11, 2009; 5(8): 2115–2124.
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
5楼2014-07-10 17:15:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 336求调剂,一志愿中科大 +7 墨彧 yuyu 2026-04-06 7/350 2026-04-07 08:58 by Jaylen.
[考研] 软工学硕299求调剂 +4 useryy 2026-04-07 4/200 2026-04-07 08:39 by 蓝云思雨
[考研] 0703化学 +20 妮妮ninicgb 2026-04-04 23/1150 2026-04-06 23:06 by chenzhimin
[考研] 081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校 +18 披星河 2026-04-03 18/900 2026-04-06 13:55 by BruceLiu320
[考研] 346分的生物与医药08600求调剂 +6 常雨阳上岸 2026-04-05 7/350 2026-04-06 12:36 by lys0704
[考研] 294求调剂 +4 Grey_Ey 2026-04-01 5/250 2026-04-05 23:05 by Grey_Ey
[考研] 320分人工智能调剂 +8 振—TZ 2026-04-03 8/400 2026-04-05 22:33 by 范式思维
[考研] 316求调剂 +5 yyx想调剂 2026-04-05 5/250 2026-04-05 22:22 by 咔咔咔咔9
[考研] 一志愿9材料学硕297已过六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-04-04 12/600 2026-04-05 19:04 by 蓝云思雨
[考研] 277求调剂 +5 考研调剂lxh 2026-04-05 5/250 2026-04-05 19:03 by chy09050039
[考研] 调剂 +8 熊二想上岸 2026-04-04 8/400 2026-04-05 05:27 by houyaoxu
[考研] 考研调剂 +5 四川王涛 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:18 by 啵啵啵0119
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 考研调剂 +8 不爱喝饮料 2026-04-03 8/400 2026-04-03 16:40 by Mistake-J
[考研] 319求调剂 +18 太容易1018 2026-04-01 18/900 2026-04-03 11:18 by linyelide
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-04-02 4/200 2026-04-02 13:03 by yulian1987
[考研] 348环境工程调剂 +3 吴彦祖24k 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:14 by nanaliuyun
[考研] 279求调剂 +7 莫xiao 2026-04-01 7/350 2026-04-01 22:05 by 客尔美德
[考研] 310分求调剂 +4 成功上岸wang 2026-04-01 4/200 2026-04-01 20:35 by liu823948201
[考研] 080500-315分复试调剂 +9 上岸3821 2026-03-31 9/450 2026-03-31 17:29 by 唐沐儿
信息提示
请填处理意见