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幸福铃铛韩玲

铁虫 (初入文坛)

[求助] 菌根提取DNA 后,测序情况,求交流!!!!谢谢 已有2人参与

我是初做菌根方面的新手,各个环节还出于懵懂状态,我想请教一下做这方面的前辈们,提取菌根DNA后,关于测序方面,前辈们用的是第几代测序?测序的效果如何?我的测序结果相当不好,跪求前辈们支教!!谢谢!!!!!!!
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happy6

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼主要有测序技术解决什么问题,测序结果不好问题大宽泛啦,目前有一代测序二代测序还有三代测序,楼主是什么测序呢。建议说明研究目的,然后才好给你回答呀。
2楼2014-07-07 14:07:11
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倪秋丹

新虫 (小有名气)

你好,我们是做菌根对植物生理方面的研究,至今还没有涉及到分子方面的,不好意思哦,帮不到你的忙!
3楼2014-07-08 08:06:35
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幸福铃铛韩玲

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by happy6 at 2014-07-07 14:07:11
楼主要有测序技术解决什么问题,测序结果不好问题大宽泛啦,目前有一代测序二代测序还有三代测序,楼主是什么测序呢。建议说明研究目的,然后才好给你回答呀。

您好,谢谢您的回复,我们目前还是在用一代测序,测序的主要目的就是对它进行归属分类。每次测序结果的峰图都不是很好,进行比对以后也不是很有说服力。想问一下做菌根分子方面的前辈,目前的菌根测序通常用什么测序方法效果最好呢?谢谢您的指教,谢谢!您如果了解这方面,请指教一下!
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4楼2014-07-08 15:56:47
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匿名

用户注销 (著名写手)

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本帖仅楼主可见
5楼2014-07-09 11:05:23
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happy6

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 幸福铃铛韩玲 at 2014-07-08 15:56:47
您好,谢谢您的回复,我们目前还是在用一代测序,测序的主要目的就是对它进行归属分类。每次测序结果的峰图都不是很好,进行比对以后也不是很有说服力。想问一下做菌根分子方面的前辈,目前的菌根测序通常用什么测 ...

菌根分子我还不太清楚,只是懂一些二代测序的知识。以为楼主要问二代测序呢。
6楼2014-07-09 17:09:57
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幸福铃铛韩玲

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 倪秋丹 at 2014-07-08 08:06:35
你好,我们是做菌根对植物生理方面的研究,至今还没有涉及到分子方面的,不好意思哦,帮不到你的忙!

亲,您是不是也参加了这次在兰州举行的菌根学术会议?我在汇报册上看到可您的名字哦
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7楼2014-07-16 16:15:58
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幸福铃铛韩玲

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by kerrylee_tw at 2014-07-09 11:05:23
峰图不好肯定是DNA有问题嘛,多半参杂了其它外源DNA...

是的,样品不纯,可是菌根就是真菌和植物的根的共生体啊,不只是一种的DNA..所以我要是测序峰图是很杂的。好忧桑。。。。
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8楼2014-07-16 16:18:04
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