应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 关于湖泊沉积物DNA提取的问题！
51/1返回列表
查看: 941  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

EATY

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于湖泊沉积物DNA提取的问题！ 已有2人参与

用Fast DNA spin kit for soil试剂盒提取的湖泊沉积物DNA ，OD260/OD280  1.7左右    OD260/OD230  0.2左右 （很低了）   不知道这些DNA能不能用于后续的实验（DGGE、、克隆测序、定量PCR等）？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我待实验如初恋，实验虐我千百遍
1楼 2014-06-26 17:05:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

EATY

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-06-27 11:34:28
做克隆测序没啥问题，但是我比较怀疑的是，非单一物质，如何进行检测。

你提取的数字260/230显示那些酚氯仿之类的有机溶剂太多了

5楼2014-06-28 17:45:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
EATY(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-06-26 22:07:07
关于DNA纯度鉴定，纯的DNA溶液其OD260/OD280应为1.8，OD260/OD230应大于2.0。OD260/OD280≈1.8(＞1.9，表明有RNA污染；＜1.6，表明有蛋白质、酚等污染）

OD230、260、280、320下的吸光度分别代表了盐浓度、核酸、蛋白等有机物、背景（溶液浑浊度）的值。一般的，我们只看OD260/OD280（Ratio)。不知道你的OD260/OD280比值是多少？
制备基因组DNA通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素，以保证DNA的完整性，为后续的实验打下基础。

除了测浓度外，还可以跑个电泳来鉴定一下：取1μg基因组DNA，在0.8%琼脂糖凝胶上电泳，检测DNA的完整性，或多个样品的浓度是否相同。电泳结束后在点样孔附近应有单一的高分子量条带。
我提的DNAOD260/OD280在2.1~2.3之间
那有可能存在RNA的污染，加RNA酶处理一下吧！如果DNA浓度产量较高的话，可以重复抽提步骤一遍。
先跑个电泳看看如何吧？
赞一下(1人) 回复此楼
人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
2楼2014-06-26 21:57:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-29 17:40:11
做克隆测序没啥问题，但是我比较怀疑的是，非单一物质，如何进行检测。

你提取的数字260/230显示那些酚氯仿之类的有机溶剂太多了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

EATY
天行健
4楼2014-06-27 11:34:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 307求调剂 +5 wyyyqx 2026-03-01 5/250 2026-03-01 15:21 by Fff-1
[考研] 295复试调剂 +3 简木ChuFront 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:27 by zzxw520th
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +3 15779376950 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:27 by 15779376950
[考研] 291分工科求调剂 +8 science饿饿 2026-03-01 9/450 2026-03-01 14:22 by Ducount.Y
[考研] 材料学调剂 +8 提神豆沙包 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:14 by peike
[考研] 材料284求调剂，一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 0805总分292，求调剂 +3 幻想之殇 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:11 by yc258
[考研] 290求调剂 +8 材料专硕调剂； 2026-02-28 9/450 2026-03-01 12:46 by 闭眼看蓝天
[考研] 0856化工专硕求调剂 +6 董boxing 2026-03-01 6/300 2026-03-01 12:45 by houyaoxu
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 高分子化学与物理调剂 +5 好好好1233 2026-02-28 9/450 2026-03-01 10:59 by fengyu211
[考研] 311求调剂 +9 南迦720 2026-02-28 10/500 2026-03-01 10:55 by sunny81
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业，申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[考研] 298求调剂 +5 axyz3 2026-02-28 5/250 2026-03-01 06:45 by 刘兵
[考研] 272求调剂 +4 田智友 2026-02-28 4/200 2026-03-01 06:43 by 刘兵
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧？ +5 ieewxg 2026-02-25 6/300 2026-03-01 00:10 by addressing
[考博] 26申博 +4 想申博！ 2026-02-26 4/200 2026-02-28 21:37 by limorning
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +4 礼堂丁真258 2026-02-28 6/300 2026-02-28 16:18 by 求调剂zz
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭