应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 关于湖泊沉积物DNA提取的问题！
51/1返回列表
查看: 962  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

EATY

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于湖泊沉积物DNA提取的问题！ 已有2人参与

用Fast DNA spin kit for soil试剂盒提取的湖泊沉积物DNA ，OD260/OD280  1.7左右    OD260/OD230  0.2左右 （很低了）   不知道这些DNA能不能用于后续的实验（DGGE、、克隆测序、定量PCR等）？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我待实验如初恋，实验虐我千百遍
1楼 2014-06-26 17:05:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

EATY

铜虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-06-27 11:34:28
做克隆测序没啥问题，但是我比较怀疑的是，非单一物质，如何进行检测。

你提取的数字260/230显示那些酚氯仿之类的有机溶剂太多了

5楼2014-06-28 17:45:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
EATY(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-06-26 22:07:07
关于DNA纯度鉴定，纯的DNA溶液其OD260/OD280应为1.8，OD260/OD230应大于2.0。OD260/OD280≈1.8(＞1.9，表明有RNA污染；＜1.6，表明有蛋白质、酚等污染）

OD230、260、280、320下的吸光度分别代表了盐浓度、核酸、蛋白等有机物、背景（溶液浑浊度）的值。一般的，我们只看OD260/OD280（Ratio)。不知道你的OD260/OD280比值是多少？
制备基因组DNA通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素，以保证DNA的完整性，为后续的实验打下基础。

除了测浓度外，还可以跑个电泳来鉴定一下：取1μg基因组DNA，在0.8%琼脂糖凝胶上电泳，检测DNA的完整性，或多个样品的浓度是否相同。电泳结束后在点样孔附近应有单一的高分子量条带。
我提的DNAOD260/OD280在2.1~2.3之间
那有可能存在RNA的污染，加RNA酶处理一下吧！如果DNA浓度产量较高的话，可以重复抽提步骤一遍。
先跑个电泳看看如何吧？
赞一下(1人) 回复此楼
人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
2楼2014-06-26 21:57:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-29 17:40:11
做克隆测序没啥问题，但是我比较怀疑的是，非单一物质，如何进行检测。

你提取的数字260/230显示那些酚氯仿之类的有机溶剂太多了
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

EATY
天行健
4楼2014-06-27 11:34:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 265求调剂 +10 梁梁校校 2026-03-17 10/500 2026-03-23 21:17 by 一切OK
[考研] 一志愿中国石油大学（华东） 本科齐鲁工业大学 +4 石能伟 2026-03-17 4/200 2026-03-23 17:51 by 17862566385
[考研] 316求调剂 +7 梁茜雯 2026-03-19 7/350 2026-03-23 16:21 by lingjue
[考研] 328求调剂 +4 LHHL66 2026-03-23 4/200 2026-03-23 14:55 by lbsjt
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +11 枫桥ZL 2026-03-18 13/650 2026-03-22 20:26 by edmund7
[考研] 寻找调剂 +4 倔强芒? 2026-03-21 4/200 2026-03-22 16:14 by 木托莫露露
[考研] 305分求调剂（食品工程） +4 Sxy112 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:26 by 无懈可击111
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 280求调剂 +11 咕噜晓晓 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:40 by ACS Nano——
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 一志愿南大，0703化学，分数336，求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂 +12 yangfz 2026-03-17 12/600 2026-03-21 03:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭