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EATY

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于湖泊沉积物DNA提取的问题! 已有2人参与

用Fast DNA spin kit for soil试剂盒提取的湖泊沉积物DNA ,OD260/OD280  1.7左右    OD260/OD230  0.2左右 (很低了)   不知道这些DNA能不能用于后续的实验(DGGE、、克隆测序、定量PCR等)?
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飞约疯人院

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科学怪人

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
EATY(myprayer代发): 金币+2, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-06-26 22:07:07
关于DNA纯度鉴定,纯的DNA溶液其OD260/OD280应为1.8,OD260/OD230应大于2.0。OD260/OD280≈1.8(>1.9,表明有RNA污染;<1.6,表明有蛋白质、酚等污染)

OD230、260、280、320下的吸光度分别代表了盐浓度、核酸、蛋白等有机物、背景(溶液浑浊度)的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio)。不知道你的OD260/OD280比值是多少?
制备基因组DNA通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。

除了测浓度外,还可以跑个电泳来鉴定一下:取1μg基因组DNA,在0.8%琼脂糖凝胶上电泳,检测DNA的完整性,或多个样品的浓度是否相同。电泳结束后在点样孔附近应有单一的高分子量条带。
我提的DNAOD260/OD280在2.1~2.3之间
那有可能存在RNA的污染,加RNA酶处理一下吧!如果DNA浓度产量较高的话,可以重复抽提步骤一遍。
先跑个电泳看看如何吧?
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
2楼2014-06-26 21:57:06
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EATY

铜虫 (初入文坛)

内容已删除
我待实验如初恋,实验虐我千百遍
3楼2014-06-27 09:04:43
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youlinglyw

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优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-06-29 17:40:11
做克隆测序没啥问题,但是我比较怀疑的是,非单一物质,如何进行检测。

你提取的数字260/230显示那些酚氯仿之类的有机溶剂太多了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

天行健
4楼2014-06-27 11:34:28
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EATY

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-06-27 11:34:28
做克隆测序没啥问题,但是我比较怀疑的是,非单一物质,如何进行检测。

你提取的数字260/230显示那些酚氯仿之类的有机溶剂太多了

5楼2014-06-28 17:45:40
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