24小时热门版块排行榜    

查看: 2301  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

naterriver

至尊木虫 (正式写手)

[求助] 求问cluster中键长和配位数统计用什么软件 已有1人参与

最近刚开始学习使用lammps,现在做的计算是一个1w+原子数的cluster,我已经得到了relax之后的坐标文件(dump),求问有没有能得出cluster中每个原子在一定cutoff距离内的配位数以及每个原子和周围原子键长分布统计的软件?

可能表述有些不清晰,请用过lammps高手们帮忙看看,十分感谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

naterriver

至尊木虫 (正式写手)

最后还是自己编段小程序解决了
3楼2014-06-25 09:02:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

starlink

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
naterriver: 金币+20, 有帮助, 感谢帮助,虽然ovito还是无法实现 2014-06-25 09:02:19
naterriver(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-25 14:08:40
ovito可以实现你要的功能,radial distribution function
2楼2014-06-23 15:22:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jin9090900

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by naterriver at 2014-06-25 09:02:39
最后还是自己编段小程序解决了

请问程序如何编啊?求经验~谢谢
4楼2014-06-27 11:02:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

naterriver

至尊木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jin9090900 at 2014-06-27 11:02:51
请问程序如何编啊?求经验~谢谢...

我是用fortran编写的,matlab或者C++也可以吧
就是把每个原子和其它原子的距离算出来,自己设定cutoff内的平俊距离算出来
5楼2014-06-28 22:13:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 7/350 2026-09-01 15:18 by myrtle
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见