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naterriver

至尊木虫 (正式写手)

[求助] 求问cluster中键长和配位数统计用什么软件 已有1人参与

最近刚开始学习使用lammps,现在做的计算是一个1w+原子数的cluster,我已经得到了relax之后的坐标文件(dump),求问有没有能得出cluster中每个原子在一定cutoff距离内的配位数以及每个原子和周围原子键长分布统计的软件?

可能表述有些不清晰,请用过lammps高手们帮忙看看,十分感谢!
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naterriver

至尊木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jin9090900 at 2014-06-27 11:02:51
请问程序如何编啊?求经验~谢谢...

我是用fortran编写的,matlab或者C++也可以吧
就是把每个原子和其它原子的距离算出来,自己设定cutoff内的平俊距离算出来
5楼2014-06-28 22:13:42
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starlink

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
naterriver: 金币+20, 有帮助, 感谢帮助,虽然ovito还是无法实现 2014-06-25 09:02:19
naterriver(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流! 2014-06-25 14:08:40
ovito可以实现你要的功能,radial distribution function
2楼2014-06-23 15:22:55
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naterriver

至尊木虫 (正式写手)

最后还是自己编段小程序解决了
3楼2014-06-25 09:02:39
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jin9090900

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by naterriver at 2014-06-25 09:02:39
最后还是自己编段小程序解决了

请问程序如何编啊?求经验~谢谢
4楼2014-06-27 11:02:51
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