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追邃2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-06-12 23:13:29
建议这个样品直接提一下质粒测序吧,这个结果不是你的样品的。前后都没有通用引物序列。

恩,谢谢,你说有没有可能我设计的引物不成功,所以测序结果里没有我想要的,还有昨天问的老师,他说做菌落PCR时,引物一个是M13一个是自己设计的引物,不知道你做的时候怎么用的引物呢?
11楼2014-06-13 06:47:47
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追邃2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-06-12 23:13:29
建议这个样品直接提一下质粒测序吧,这个结果不是你的样品的。前后都没有通用引物序列。

恩,谢谢,你说有没有可能我设计的引物不成功,所以测序结果里没有我想要的,还有昨天问的老师,他说做菌落PCR时,引物一个是M13一个是自己设计的引物,不知道你做的时候怎么用的引物呢?
12楼2014-06-13 07:29:06
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追邃2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-06-12 23:13:29
建议这个样品直接提一下质粒测序吧,这个结果不是你的样品的。前后都没有通用引物序列。

恩,是的啊,请问质粒如何提取,有没有具体的方法啊?
13楼2014-06-13 07:32:20
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追邃2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-06-12 23:13:29
建议这个样品直接提一下质粒测序吧,这个结果不是你的样品的。前后都没有通用引物序列。

恩,我试试
14楼2014-06-13 09:48:44
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追邃2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by liug268 at 2014-06-12 22:38:20
那就是结果发错人了吧,跟玉米相似度如此之高。
建议跟测序公司询问一下。当然还有可能你们的PCR产物污染了...

我送的是菌液,怎么会pcr污染呢?
15楼2014-06-13 09:49:47
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
13楼: Originally posted by 追邃2015 at 2014-06-13 07:32:20
恩,是的啊,请问质粒如何提取,有没有具体的方法啊?...

如果是个单独的样品就直接用提质粒试剂盒提算了。要是大提就用碱裂解法提质粒吧,网上的方法多得很。
大家相互帮助哈
16楼2014-06-13 14:07:29
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
追邃2015(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-13 16:31:59
引用回帖:
12楼: Originally posted by 追邃2015 at 2014-06-13 07:29:06
恩,谢谢,你说有没有可能我设计的引物不成功,所以测序结果里没有我想要的,还有昨天问的老师,他说做菌落PCR时,引物一个是M13一个是自己设计的引物,不知道你做的时候怎么用的引物呢?...

1.因为你这个引物是简并引物,所以你扩增出的基因两端序列其实你还是不清楚的。所以你连上T载体需要用通用引物去验证。pmD-19T的公司测序就是用的M13R/F引物扩增的。做菌落PCR M13R/F也是可以的。你的模板是cDNA还是基因组,要克隆的序列大小知道吗?从你的测序结果看,我感觉测的还是你插入核酸的序列。先确认下测序编号是不是你的,如果送质粒测序还是这个结果的话,那你的模板再确认下吧。
2.一般如果序列比较明确的话,就不需要简并引物,直接用特异性引物扩增就好了,连上T载体也是用你克隆的引物验证就没问题了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

大家相互帮助哈
17楼2014-06-13 14:54:07
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追邃2015

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
17楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-06-13 14:54:07
1.因为你这个引物是简并引物,所以你扩增出的基因两端序列其实你还是不清楚的。所以你连上T载体需要用通用引物去验证。pmD-19T的公司测序就是用的M13R/F引物扩增的。做菌落PCR M13R/F也是可以的。你的模板是cDNA还 ...

模版是cDNA,目的片段620bp,这是我菌落PCR的图片,其中左边Marker1000,前6个样品引物为M13,后六个样品引物是M13和我设计的简并引物,再往后2个是我之前传上去的测序结果的菌落pcr(引物M13),一直找不到原因,为什么测不出来。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
请问我的菌落PCR测序产物目的片段是什么
PCR M13 3A-3F M13.NR1 A-F 以前结果  2014-06-13 09hr 58min.jpg

18楼2014-06-13 15:51:50
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追邃2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sometimess at 2014-06-12 14:51:50
怎么在序列里面没有找到该载体的克隆位点、

那是不是我没转化进去呢?
19楼2014-06-13 15:56:34
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追邃2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
18楼: Originally posted by 追邃2015 at 2014-06-13 15:51:50
模版是cDNA,目的片段620bp,这是我菌落PCR的图片,其中左边Marker1000,前6个样品引物为M13,后六个样品引物是M13和我设计的简并引物,再往后2个是我之前传上去的测序结果的菌落pcr(引物M13),一直找不到原因,为什 ...

以上的第二个6个样品的引物是M13F-我自己设计的下游引物,另外我刚做了拿我自己的引物做菌落pcr验证,以下是图片:麻烦你帮我看看是我哪部出错了吗?这个测序都快一个月了,太烦人了,刚换了家测序公司,不知道结果怎么样呢?
请问我的菌落PCR测序产物目的片段是什么-1
菌落pcr全是自己的引物 2014-06-13 16hr 02min.jpg

20楼2014-06-13 16:15:15
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