| 查看: 6394 | 回复: 49 | |||||
[交流]
国产分子动力学计算软件BeeMD正式上线，欢迎下载测试已有32人参与
|
|
如题，历经十多年开发，包含计算、分析和可视化全套。 计算速度和主流MD软件一样，自动多线程（OpenMP），MPI并行，CUDA 完全免费，欢迎大家使用。请到 BeeMD.org 查看更多介绍。 我们已经成立了自助开发团队，诚邀各方大拿参加开发， 急需如下方面合作开发，有底子的才俊别保留啊， .....SIMD优化， .....单精度优化， .....CUDA优化， .....QM模块， .....力场开发。 速度：双精度版本和GROMACS差不多了，还未做单精度优化。 特点：我们注重增强采样相关开发，支持script编程，扩展开发比GROMACS,AMBER,NAMD容易，还有就是国产，我们能给国内用户提供面对面的使用和开发交流，为用户实现特定需求开发。 附件中是Windows下多线程版本的binaries，其它系统的请到主页下载， 如需从源码编译，请联系我们[ Last edited by beeMD on 2014-6-11 at 11:06 ] 这个MD软件大概构架和功能我们已都开发好，做基本的MD应用计算应该足够了，希望大家用这个软件做些工作，如果有好的应用可联系我们，我们可帮着作，希望有能力的才俊能来参加开发，起点赿低赿好，有一定C语言基础即可，自愿参与，我们不发工资的，但会给做些初步的开发培训，国外MD软件也不是一天写成的，抛砖引玉，希望能有真正创新能力的后来者，这个事情国内总得有人做，请大家多多支持！！！ 目前急寻自主QM Module，有知道的学友请帮忙引荐 [ Last edited by beeMD on 2014-6-12 at 23:49 ] 我虽已不做学术，还是给下本人的简介，去年年底开始组建Modar开发团队，队里的其他成员，等我征得他们同意后公布， 2005 中科院生物物理所毕业， 2005－2011 Florida State University, 2011 回国创业， 刚回国前两年没大多时间打理MD开发，最新有些时间出来和大家交流，请大伙多多支持！！！ 学术上几乎没有成就，拿的出手的是篇共同一作的PNAS的算法短文，如感兴趣，请大伙自行搜索 "Random walk in orthogonal space to achieve efficient free-energy simulation of complex systems" 在些我感谢Dr. Wei Yang对我放弃学术工作的理解 之前开发过一个可视化软件，详见 noch dot sourceforge dot net 曾经也有不少欧美学者使用，后来出国工作没时间维护，现在更名为Movar 打包在Modar中，Modar是10多年龟速积累的结果，希望国内的学者能多做些开发工作，有能力就来接管我们的开发工作。 [ Last edited by beeMD on 2014-6-13 at 12:57 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : modar_for_MSWindows-Jun06-2014.zip
2014-06-09 15:41:23, 9.77 M
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 分子动力学 | 凝聚态物理知识 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
maslhevttc» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有21人回复
-
导师想让我从独立一作变成了共一第一
已经有5人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有11人回复
-
读博
已经有4人回复
-
JMPT 期刊投稿流程
已经有4人回复
-
心脉受损
已经有5人回复
-
Springer期刊投稿求助
已经有4人回复
-
小论文投稿
已经有3人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有9人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
iamthinking
铁杆木虫 (正式写手)
浪客琴心
- 应助: 31 (小学生)
- 金币: 9202.6
- 红花: 5
- 帖子: 371
- 在线: 145.7小时
- 虫号: 1400522
- 注册: 2011-09-13
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
2楼2014-06-09 16:27:14
3楼2014-06-09 18:55:44
jianchen7882
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 1402
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 76.1小时
- 虫号: 2182099
- 注册: 2012-12-12
- 性别: GG
- 专业: 分离过程
4楼2014-06-10 07:53:42
5楼2014-06-10 12:58:00
zhengpc3505
金虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 193
- 散金: 15
- 红花: 3
- 帖子: 268
- 在线: 175.6小时
- 虫号: 729426
- 注册: 2009-03-23
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
6楼2014-06-10 15:07:40
老虎大王
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 17
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 4774.1
- 散金: 8
- 红花: 42
- 帖子: 1361
- 在线: 215.2小时
- 虫号: 659094
- 注册: 2008-11-21
- 专业: 金属结构材料
7楼2014-06-10 15:30:51
8楼2014-06-10 15:45:44
9楼2014-06-10 16:08:48
10楼2014-06-11 08:18:36