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国产分子动力学计算软件BeeMD正式上线，欢迎下载测试 已有32人参与
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如题，历经十多年开发，包含计算、分析和可视化全套。 计算速度和主流MD软件一样，自动多线程（OpenMP），MPI并行，CUDA 完全免费，欢迎大家使用。请到 BeeMD.org 查看更多介绍。 我们已经成立了自助开发团队，诚邀各方大拿参加开发， 急需如下方面合作开发，有底子的才俊别保留啊， .....SIMD优化， .....单精度优化， .....CUDA优化， .....QM模块， .....力场开发。 速度：双精度版本和GROMACS差不多了，还未做单精度优化。 特点：我们注重增强采样相关开发，支持script编程，扩展开发比GROMACS,AMBER,NAMD容易，还有就是国产，我们能给国内用户提供面对面的使用和开发交流，为用户实现特定需求开发。 附件中是Windows下多线程版本的binaries，其它系统的请到主页下载， 如需从源码编译，请联系我们[ Last edited by beeMD on 2014-6-11 at 11:06 ] 这个MD软件大概构架和功能我们已都开发好，做基本的MD应用计算应该足够了，希望大家用这个软件做些工作，如果有好的应用可联系我们，我们可帮着作，希望有能力的才俊能来参加开发，起点赿低赿好，有一定C语言基础即可，自愿参与，我们不发工资的，但会给做些初步的开发培训，国外MD软件也不是一天写成的，抛砖引玉，希望能有真正创新能力的后来者，这个事情国内总得有人做，请大家多多支持！！！ 目前急寻自主QM Module，有知道的学友请帮忙引荐 [ Last edited by beeMD on 2014-6-12 at 23:49 ] 我虽已不做学术，还是给下本人的简介，去年年底开始组建Modar开发团队，队里的其他成员，等我征得他们同意后公布， 2005 中科院生物物理所毕业， 2005－2011 Florida State University, 2011 回国创业， 刚回国前两年没大多时间打理MD开发，最新有些时间出来和大家交流，请大伙多多支持！！！ 学术上几乎没有成就，拿的出手的是篇共同一作的PNAS的算法短文，如感兴趣，请大伙自行搜索 "Random walk in orthogonal space to achieve efficient free-energy simulation of complex systems" 在些我感谢Dr. Wei Yang对我放弃学术工作的理解 之前开发过一个可视化软件，详见 noch dot sourceforge dot net 曾经也有不少欧美学者使用，后来出国工作没时间维护，现在更名为Movar 打包在Modar中，Modar是10多年龟速积累的结果，希望国内的学者能多做些开发工作，有能力就来接管我们的开发工作。 [ Last edited by beeMD on 2014-6-13 at 12:57 ] |
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本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : modar_for_MSWindows-Jun06-2014.zip
2014-06-09 15:41:23, 9.77 M
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