应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 溶液离子与聚合物相互作用的软件，求推荐
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1315  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 溶液离子与聚合物相互作用的软件，求推荐 已有1人参与

如题，我想模拟溶液环境（H2O、Na+、K+、Ca2+、Cl-等等）对聚合物构象的影响，聚合物挺大的，有3~4万分子量

首先我用MS中的 Amorphous Cell建里包含2000个H2O，100个Na+，100个Cl-的盒子，再把聚合物片段放进去，用NVT跑动力学

可是，算的好慢啊，而且只是取了聚合物的片段，准确性还有待考证，请问各位大侠，有没有好的建议？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-06-05 14:35:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qianxiong at 2014-06-05 14:48:15
gromacs会比较快，但需要自己建力场。
我用GMX在16个核（intel，2.2G ）的服务器，11万原子数的体系，charmm力场，cutoff 为 1nm， PME处理长程静电力，一天可以跑7-8ns左右

请问你算的是全原子模型还是粗粒化模型？

你也是自己建的力场吗？我没有自己建过力场，难学吗？
赞一下 回复此楼
3楼2014-06-05 14:50:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

qianxiong

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
赵红霞: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-06-05 15:52:29
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-06-17 15:45:01
gromacs会比较快，但需要自己建力场。
我用GMX在16个核（intel，2.2G ）的服务器，11万原子数的体系，charmm力场，cutoff 为 1nm， PME处理长程静电力，一天可以跑7-8ns左右
赞一下 回复此楼
戒微博
2楼2014-06-05 14:48:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-06-17 15:45:06
引用回帖:
3楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-06-05 14:50:47
请问你算的是全原子模型还是粗粒化模型？

你也是自己建的力场吗？我没有自己建过力场，难学吗？...

http://www.docin.com/p-767742346.html

你看看这个文章
在找找DPD模拟的相关文章
或许能满足你的要求
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2014-06-05 15:35:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 应助指数+1, 鼓励交流！ 2014-06-17 15:45:13
http://wenku.baidu.com/link?url= ... EMOEjVd-bXcSBzNgIhm

DPD我不太懂，这里有用blend模块获得DPD参数的方法
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2014-06-05 15:37:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂，一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +8 @taotao 2026-03-29 8/400 2026-03-30 20:48 by dophin1985
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学材料与化工方向336分 +12 辰沐5211314 2026-03-26 12/600 2026-03-30 19:28 by Wang200018
[考研] 349求调剂 +3 田洪有 2026-03-30 3/150 2026-03-30 19:11 by 迷糊CCPs
[有机交流] 考研调剂 +8 watb 2026-03-26 8/400 2026-03-30 18:40 by 544594351
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求调剂 +12 芋泥小铃铛 2026-03-28 12/600 2026-03-30 17:06 by wangjy2002
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-03-26 6/300 2026-03-29 01:11 by hanserlol
[考研] 356求调剂 +3 gysy?s?a 2026-03-28 3/150 2026-03-29 00:33 by 544594351
[考研] 11408软件工程求调剂 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 21:50 by zhq0425
[考研] 315求调剂 +4 akie... 2026-03-28 5/250 2026-03-28 21:05 by zhq0425
[考研] 一志愿华理，数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 12/600 2026-03-28 18:15 by AZMK
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-27 6/300 2026-03-28 14:10 by 唐沐儿
[考研] 299求调剂 +7 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 7/350 2026-03-28 13:09 by 唐沐儿
[材料工程] 一志愿C9材料与化工专业总分300求调剂 +8 曼111 2026-03-24 9/450 2026-03-28 07:58 by YYYYX1234
[考研] 086000调剂 +3 7901117076 2026-03-26 3/150 2026-03-27 21:34 by Jianing_Mi
[考研] 266求调剂 +11 阳阳哇塞 2026-03-27 12/600 2026-03-27 17:56 by yu221
[考研] 272求调剂 +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-27 17:23 by laoshidan
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 调剂 +3 李嘉图·S·路 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:19 by wangjy2002
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 材料考研调剂生 +3 黄粱一梦千年 2026-03-24 3/150 2026-03-24 17:00 by barlinike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭