24小时热门版块排行榜    

查看: 2924  |  回复: 6

tuxiong_1986

新虫 (初入文坛)

[求助] 求大神帮忙,高斯09 “open-new-file”错误 已有2人参与

各路大神,我使用相同的高斯GJF计算文件,相同的LSF文件向超算的计算节点提交高斯任务,甚至能看到是在超算的相同节点上计算的,但是会有一部分任务(出现概率大约为30%)的log文件停止在“open-new-file”,然后就结束了。过会使用相同的GJF文件和LSF文件提交,又可以正常完成计算了,有没有大神知道是为什么?

我的Log文件的最后几行如下:
******************************************
Gaussian 09:  ES64L-G09RevD.01 24-Apr-2013
                 3-Jun-2014
******************************************
%NProcShared=4
Will use up to    4 processors via shared memory.
%LindaWorker=echo,
%mem=4096MB
%chk=gaussian_check_file.chk
fname=/home-gg/Soft/Gaussian.D01.Linda/g09/scratch/Gau-18216.rwf fd = -1

open-new-file

跪求各位大神
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhficcas

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2014-06-03 18:26:24
系统的问题, 再次提交就可以了,也有可能是输出文件的位置不同引起的, 放在默认的目录下试一试。
2楼2014-06-03 18:07:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuhaixx

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2014-06-04 09:32:40
tuxiong_1986: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-06-04 18:10:34
小shen同志,注意下并行文件系统的bug,这应该不是g09的问题:
同路径,同文件名的文件,NFS共享大并发下更新可能存在延迟,你读取的可能是旧的文件。

目前的解决办法,最好是避免使用相同路径和文件名的文件。期待超算停机维护,哈哈哈~
3楼2014-06-04 09:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tuxiong_1986

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liuhaixx at 2014-06-04 09:24:26
小shen同志,注意下并行文件系统的bug,这应该不是g09的问题:
同路径,同文件名的文件,NFS共享大并发下更新可能存在延迟,你读取的可能是旧的文件。

目前的解决办法,最好是避免使用相同路径和文件名的文件。 ...

嘿嘿,都知道我是小shen同志了啊,这个问题太恼人了。
我的路径每次都是不一样的,但是高斯的log文件和lsf文件的文件名是相同的,你的意思是我应该每次把log和lsf系统的文件名换一下??
4楼2014-06-04 09:36:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tuxiong_1986

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhficcas at 2014-06-03 18:07:32
系统的问题, 再次提交就可以了,也有可能是输出文件的位置不同引起的, 放在默认的目录下试一试。

但是我的程序有要求每次都在不同的路径下
5楼2014-06-04 09:38:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tuxiong_1986

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liuhaixx at 2014-06-04 09:24:26
小shen同志,注意下并行文件系统的bug,这应该不是g09的问题:
同路径,同文件名的文件,NFS共享大并发下更新可能存在延迟,你读取的可能是旧的文件。

目前的解决办法,最好是避免使用相同路径和文件名的文件。 ...

你所说的可能是正解,小木虫大神就是多!!
6楼2014-06-04 10:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuhaixx

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by tuxiong_1986 at 2014-06-04 10:00:35
你所说的可能是正解,小木虫大神就是多!!...

那有没有解决问题哈。。。lsf文件应该不至于,这个归lsf platform管。log文件,你如果要读取里面的信息,可能会读到旧的文件内容,然后去取scratch目录里面旧的临时rwf文件导致不存在
7楼2014-06-05 17:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tuxiong_1986 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 让我中一个面上吧! +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[基金申请] 什么时候开奖? +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 炎黄贵胄 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见