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寂寞又美好

金虫 (小有名气)

[求助] Normfinder数据输入紧急求助! 已有1人参与

各位前辈们你们好,小弟最近在用Normfinder进行内参筛选,但是对于其数据的输入处理不是很清楚,我看一些资料上说是将技术重复的3个CT值求几何平均数,然后在进行什么对数转换,没看明白,2004年的那篇文章的例子我也拿来走了一遍,但是他的原始输入数据都是5位数左右,我就想知道这数据是怎样根据CT值算得的。希望学长们不吝赐教,小弟跪谢了!
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wangy0908

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
寂寞又美好(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-11 18:56:03
推荐你去看看这篇文献
Andersen CL, Jensen JJ, Ørntoft TF (2004) Normalization of real-time quantitative reverse transcription-PCR data: a model-based variance estimation approach to identify genes suited for normalization, applied to bladder and colon cancer data sets. Cancer Res 64:5245-5250
是需要将平均CT值转换成相对值,就是用组合里面最小的CT值去和任何一个值进行比较,得到转换的相对值,然后在进行相应的计算。这篇文献介绍得非常清楚的。具体的步骤我也忘记了,因为我11年做过,这几年都没有做了的哈!
3楼2014-06-11 17:15:59
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忘忧草_

木虫 (正式写手)

你好 我也遇到类似的情况 请问您这个问题现在解决了吗
不将就
2楼2014-06-11 16:54:38
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