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Normfinder数据输入紧急求助! 已有1人参与
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| 各位前辈们你们好,小弟最近在用Normfinder进行内参筛选,但是对于其数据的输入处理不是很清楚,我看一些资料上说是将技术重复的3个CT值求几何平均数,然后在进行什么对数转换,没看明白,2004年的那篇文章的例子我也拿来走了一遍,但是他的原始输入数据都是5位数左右,我就想知道这数据是怎样根据CT值算得的。希望学长们不吝赐教,小弟跪谢了! |
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忘忧草_
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2楼2014-06-11 16:54:38
【答案】应助回帖
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寂寞又美好(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-11 18:56:03
寂寞又美好(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-11 18:56:03
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推荐你去看看这篇文献 Andersen CL, Jensen JJ, Ørntoft TF (2004) Normalization of real-time quantitative reverse transcription-PCR data: a model-based variance estimation approach to identify genes suited for normalization, applied to bladder and colon cancer data sets. Cancer Res 64:5245-5250 是需要将平均CT值转换成相对值,就是用组合里面最小的CT值去和任何一个值进行比较,得到转换的相对值,然后在进行相应的计算。这篇文献介绍得非常清楚的。具体的步骤我也忘记了,因为我11年做过,这几年都没有做了的哈! |
3楼2014-06-11 17:15:59










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