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石鸣涧

铜虫 (初入文坛)

[交流] 高分辨二级质谱解析 已有3人参与

我有两个已知结构的物质打的二级质谱,ESI源,负模式 35V,我想知道含量最大的碎片峰的结构是什么?根据结构2已有有二级质谱,说这个碎片峰的结构是结构3,但我用chemdraw画了下这个结构,发现分子量是275,负模式M-H也应该是274才对,但打出来却是272,搞不懂,请高手指教!
谱图如下:
高分辨二级质谱解析
1.png


高分辨二级质谱解析-1
2.png


高分辨二级质谱解析-2
3(碎片可能结构).png
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wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 石鸣涧 at 2014-05-18 18:59:17
非常感谢楼上的回答!但我还是知道它为什么会形成这样的结构呢,是醚键断裂会比较容易形成这种重排,还是说断裂成这样的碎片会比较稳定?如果不发生这样的重排的话,两个碎片是不是会各带有一个孤对电子呢?我 ...

对于正离子或者负离子模式下的裂解方式很少有系统的理论支撑,这个不像EI下的裂解,我个人认为这个应该是醚键断裂的过程中产生的,用EI的理论解析未免会有一点牵强,但是对于碎片离子来讲其可能是为了保持一种稳定的结构,降低能量,而对于LCMS来讲我认为其裂解过程中应该是一对电子的转移,没有孤电子。不然生成的是奇电子离子,而LCMS应该都是偶电子离子吧

结构三的负离子模式确实是274,这个没有计算错

[M-2H]-是在负离子化后失去一份子氢气所生成的,和你理解的负离子不同,按你的理解应该带两个电荷,那么得到的就是[M-2H]2-这个是不一样的。
4楼2014-05-19 11:00:15
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wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个有可能不是你所画的结构,可能经过H四元环过渡态重排脱去醇的结构生成带烯键的结构
高分辨二级质谱解析-3
untitled.png

2楼2014-05-18 17:23:46
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石鸣涧

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wy19871124 at 2014-05-18 17:23:46
这个有可能不是你所画的结构,可能经过H四元环过渡态重排脱去醇的结构生成带烯键的结构

untitled.png

非常感谢楼上的回答!但我还是知道它为什么会形成这样的结构呢,是醚键断裂会比较容易形成这种重排,还是说断裂成这样的碎片会比较稳定?如果不发生这样的重排的话,两个碎片是不是会各带有一个孤对电子呢?我对质谱的谱图是完全不懂,还请多指教啊

还有就是这个碎片的可能结构(结构3)是metlin数据库中已有的结构2质谱碎片272对应的结构,我应该没有算错它的分子量吧,烦请帮我也看看哪!

另外有一个问题想请教,我看到其他碎片对就的结构,还有些是[M-2H]-的碎片,去两个氢不应该是带两个负电吗,怎么只带一个负电荷呢?
3楼2014-05-18 18:59:17
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wy19871124

新虫 (职业作家)

质谱首席顾问


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
裂解方式如下,醚键可以通过甲基上的氢四元环过渡态重排生成醇,而醚键断裂后剩一个孤电子,氢重拍后剩一个孤电子,两个孤电子成对,生成烯键结构。见附图,已经表示的很明确了。
高分辨二级质谱解析-4
untitled.png

5楼2014-05-19 11:25:41
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