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jiangyanxue

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何将MS中的晶体结构导出来,用GaussView打开? 已有1人参与

请问如何将MS中的晶体结构导出来,用GaussView打开?
我的晶体结构是周期性的,在MS中导出为.mol的形式不行。导出为.pdb的形式在GaussView中能打开,但是也不对。如果导出为.cif的形式可以打开,但是用高斯计算时总提示我内存不足之类的错误。请高手指点!!!
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撒哈拉1989

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-05-13 22:51:09
你可以先导出cif ,然后用别的软件转化为cubic形式(比如VESTA),然后再用gsview 打开。

您好 我刚安装gaussian03,是个初学者。我不想优化结构,想直接用gview 打开cif,但是,打开的是晶胞形式,都是不完整的分子,然后需要人为删很多原子,再重新加键 而且 键长 键角 二面角 这些数据都是从mercury 得到的 用这些数据 再去 重新调整分子 但是 太麻烦 一天了 一无进展 请问有什么好的建议吗 因为物质是多晶型,构型有些相同,不想因为个人操作 改变一些数据 增大误差 谢谢您!!
7楼2015-06-18 22:56:08
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你可以先导出cif ,然后用别的软件转化为cubic形式(比如VESTA),然后再用gsview 打开。
2楼2014-05-13 22:51:09
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jiangyanxue

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-05-13 22:51:09
你可以先导出cif ,然后用别的软件转化为cubic形式(比如VESTA),然后再用gsview 打开。

谢谢您,我的晶体结构是周期性的,原子有160多个,用高斯算总出现内存不够之类的错误,请问这是怎么回事呢?
3楼2014-05-14 08:45:09
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by jiangyanxue at 2014-05-14 08:45:09
谢谢您,我的晶体结构是周期性的,原子有160多个,用高斯算总出现内存不够之类的错误,请问这是怎么回事呢?...

没有足够的内存,计算量超过的你的机器硬件配置的内存大小。加内存条
4楼2014-05-14 12:06:35
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