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378287892

金虫 (小有名气)

[求助] 从ccdc中导出的cif导入MS后和文献中的结构不一样

大家好，我从ccdc中获得的共价有机骨架COF-1的cif文件导入MS后形成的结构与文献中的不一样，比较乱，并且各原子间也没有成键，COF-5,6,8,10结构与文献一样，但也没有成键，通过calculate bonds形成的键根本不合理，加H也不合理，这是怎么回事啊？是我导出cif文件时有问题吗？望各位高手给予指点，非常感谢！l
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1楼 2013-05-03 23:53:21
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lijiao_112

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
378287892: 金币+10, ★有帮助, 非常感谢！ 2013-05-04 21:24:29
那个你加对称性了吗?rebuild 一下试试？
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咬得菜根，百事可做。
2楼2013-05-04 10:21:38
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378287892

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lijiao_112 at 2013-05-04 10:21:38
那个你加对称性了吗?rebuild 一下试试？

你好，我用rebuid可以将键加上，对于COF-5通过修改C-C键的类型为partial double bond，结构和文献上的一样，但对于COF-6,8,10则不适用。但是COF-1的结构很乱，与文献一点都不一样。这是不是它们的cif文件有问题啊？
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3楼2013-05-04 23:04:03
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lijiao_112

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 378287892 at 2013-05-04 23:04:03
你好，我用rebuid可以将键加上，对于COF-5通过修改C-C键的类型为partial double bond，结构和文献上的一样，但对于COF-6,8,10则不适用。但是COF-1的结构很乱，与文献一点都不一样。这是不是它们的cif文件有问题啊？...

其实cif文件有时候导入MS，模型不一定就能构建出来~hard to say
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咬得菜根，百事可做。
4楼2013-05-05 09:34:12
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378287892

金虫 (小有名气)
谢谢啊！我再看看吧

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼2013-05-05 09:53:49
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