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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 请问如何将MS中的晶体结构导出来，用GaussView打开？
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jiangyanxue

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何将MS中的晶体结构导出来，用GaussView打开？ 已有1人参与

请问如何将MS中的晶体结构导出来，用GaussView打开？
我的晶体结构是周期性的，在MS中导出为.mol的形式不行。导出为.pdb的形式在GaussView中能打开，但是也不对。如果导出为.cif的形式可以打开，但是用高斯计算时总提示我内存不足之类的错误。请高手指点！！！
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1楼 2014-05-13 10:03:10
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你可以先导出cif ,然后用别的软件转化为cubic形式（比如VESTA),然后再用gsview 打开。
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2楼2014-05-13 22:51:09
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jiangyanxue

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-05-13 22:51:09
你可以先导出cif ,然后用别的软件转化为cubic形式（比如VESTA),然后再用gsview 打开。

谢谢您，我的晶体结构是周期性的，原子有160多个，用高斯算总出现内存不够之类的错误，请问这是怎么回事呢？
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3楼2014-05-14 08:45:09
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiangyanxue at 2014-05-14 08:45:09
谢谢您，我的晶体结构是周期性的，原子有160多个，用高斯算总出现内存不够之类的错误，请问这是怎么回事呢？...

没有足够的内存，计算量超过的你的机器硬件配置的内存大小。加内存条
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4楼2014-05-14 12:06:35
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风细寒烟

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by mywai520 at 2014-05-14 12:06:35
没有足够的内存，计算量超过的你的机器硬件配置的内存大小。加内存条...

内存不够它就不可以算慢一点吗？这个软件真是的，郁闷，另外的也是，真烦
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周浩......................
5楼2014-05-28 23:35:22
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mywai520

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 风细寒烟 at 2014-05-28 23:35:22
内存不够它就不可以算慢一点吗？这个软件真是的，郁闷，另外的也是，真烦...

所有的软件都如此，没有你说的这种情况。MS其实在这一块是做的最好的，至少它还可以去设置这一方面！！！
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6楼2014-05-28 23:38:53
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撒哈拉1989

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mywai520 at 2014-05-13 22:51:09
你可以先导出cif ,然后用别的软件转化为cubic形式（比如VESTA),然后再用gsview 打开。

您好 我刚安装gaussian03，是个初学者。我不想优化结构，想直接用gview 打开cif，但是，打开的是晶胞形式，都是不完整的分子，然后需要人为删很多原子，再重新加键 而且 键长 键角 二面角 这些数据都是从mercury 得到的 用这些数据 再去 重新调整分子 但是 太麻烦 一天了 一无进展 请问有什么好的建议吗 因为物质是多晶型，构型有些相同，不想因为个人操作 改变一些数据 增大误差 谢谢您！！
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7楼2015-06-18 22:56:08
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孟府青青

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 撒哈拉1989 at 2015-06-18 22:56:08
您好 我刚安装gaussian03，是个初学者。我不想优化结构，想直接用gview 打开cif，但是，打开的是晶胞形式，都是不完整的分子，然后需要人为删很多原子，再重新加键 而且 键长 键角 二面角 这些数据都是从mercury 得 ...

你好，请问你这个问题是怎么解决的啊？

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8楼2021-01-30 18:50:49
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