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Johnnase

木虫 (正式写手)

[求助] 怎么用Amorphous Cell 模块建立液态铝模型(类似水盒子模型)? 已有1人参与

请问大神,怎么用Material Studios 软件的Amorphous Cell 模块建立液态铝模型(类似水盒子模型)?本人刚学不懂,还请各位不吝赐教。
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Johnnase

木虫 (正式写手)

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2楼: Originally posted by lkd-syl at 2014-05-06 16:33:25
AC做不了吧?  液态铝的建模首先建立一个含有一定原子数量的超胞,然后做升温动力学就行了

再请问您,升温动力学需要用哪个模块?谢谢您。
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3楼2014-05-12 16:12:16
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Johnnase

木虫 (正式写手)

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4楼: Originally posted by lkd-syl at 2014-05-12 16:25:24
做倒是好几个模块都可以做的,我做的铁液凝固,用的GULP,貌似castep,dmol3都可以,关键要看你想做什么了,,,...

我其实想做铝液液滴在石墨基体上的润湿模拟,想先建立铝液液滴的模型。
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5楼2014-05-12 20:49:58
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Johnnase

木虫 (正式写手)

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引用回帖:
4楼: Originally posted by lkd-syl at 2014-05-12 16:25:24
做倒是好几个模块都可以做的,我做的铁液凝固,用的GULP,貌似castep,dmol3都可以,关键要看你想做什么了,,,...

您好,请问可以稍微具体说一说用GULP如何实现建立金属液滴模型的方法吗?我之前试过了Discover和Forcite模块,感觉都不是太好,希望用GULP试一试。还望您指教,不胜感激。
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6楼2014-06-18 09:09:00
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Johnnase

木虫 (正式写手)

送红花一朵
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7楼: Originally posted by lkd-syl at 2014-06-18 16:17:45
首先建立超胞,然后做一个恒定温度下的动力学就行了,,,参数的设置要看文献里怎么做的,,,...

原来是这样,受教了!
但是我之前也分别建立了超晶胞,然后用Discover模块Forcite做了恒温分子动力学,用的是NPT系统,尝试了不同的控温和控压模块,但是得到的液体胞要么混乱度比较差,要么体系的能量随着分子动力学过程升高,请问这样对吗?传两张图请您帮忙看看,谢谢啦。
怎么用Amorphous Cell 模块建立液态铝模型(类似水盒子模型)?
混乱度比较差的液体胞.png


怎么用Amorphous Cell 模块建立液态铝模型(类似水盒子模型)?-1
体系的能量随着分子动力学时间升高.png

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8楼2014-06-19 18:05:53
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Johnnase

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by lkd-syl at 2014-06-19 20:48:15
你可以把输入文件贴出来看看。。。。...

首先感谢您的关心。
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10楼2014-06-20 15:42:12
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Johnnase

木虫 (正式写手)

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11楼2014-06-20 15:46:57
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Johnnase

木虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by lkd-syl at 2014-06-21 11:30:11
你用那种控温方式是在看别人做的用的吗?  我见过用Brendsen的,另外那个能量升高后稳定在一个定值波动,这个没什么问题吧,因为你做的是一个升温动力学,能量升高也是理所当然的,,,...

首先感谢您的回复!
我各种控温的方式都尝试过了,包括nose、andersen和berendsen的,但是就混乱度而言我发现用verlocity scale的最好,其他几种控温方式混乱度比较差,就如同之前那张图上展示的。我看到过网上有个教程用的是nose控温方式,网址链接如下:http://www.docin.com/p-484673708.html
还有,您说我的是做的升温动力学?那么应当怎样设置为恒温动力学呢?我其实也是想做恒温动力学的。还请指导一下,不胜感激!
另外还有一点就是,选择NPT的话,那么压力应当控制为一个大气压吗?还是应当是别的数值?
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13楼2014-06-21 12:22:07
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Johnnase

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17楼2015-03-19 10:31:38
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